RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001172.11

Ankrd39-201, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 39, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd39, Length 2,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Sel1lQ9Z2G6 790 aa20.36■□□□□ 0.85
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Gm5134E9QAB5 671 aa20.35■□□□□ 0.85
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 LpxnQ99N69 386 aa20.35■□□□□ 0.85
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Baiap2l1Q9DBJ3 514 aa20.35■□□□□ 0.85
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Gm5114W4VSN8 858 aa20.35■□□□□ 0.85
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Nr5a1P33242 462 aa20.35■□□□□ 0.85
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Spata18Q0P557 537 aa20.35■□□□□ 0.85
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Nek3Q9R0A5 511 aa20.35■□□□□ 0.85
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Magi2Q9WVQ1 1275 aa20.35■□□□□ 0.85
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Lmnb1P14733 588 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Gcnt1Q09324 428 aa20.34■□□□□ 0.85
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Large2Q5XPT3 690 aa20.34■□□□□ 0.85
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Lamc2Q61092 1191 aa20.34■□□□□ 0.85
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Dusp9Q7TNL7 452 aa20.34■□□□□ 0.85
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Galnt17Q7TT15 598 aa20.34■□□□□ 0.85
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Pdzph1Q8BGR1 1238 aa20.34■□□□□ 0.85
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 IarsQ8BU30 1262 aa20.34■□□□□ 0.85
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 E2f4Q8R0K9 410 aa20.34■□□□□ 0.85
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ttll1Q91V51 423 aa20.34■□□□□ 0.85
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 BccipQ9CWI3 316 aa20.34■□□□□ 0.85
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Sgpp1Q9JI99 430 aa20.34■□□□□ 0.85
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Frmpd4A2AFR3 1320 aa20.33■□□□□ 0.85
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Pitpnm2Q6ZPQ6 1335 aa20.33■□□□□ 0.85
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Sun3Q5SS91 320 aa20.33■□□□□ 0.85
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Tmem87aQ8BXN9 555 aa20.33■□□□□ 0.85
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Pspc1Q8R326 523 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 CluhQ5SW19 1315 aa20.33■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Fam196bQ6GQV1 535 aa20.33■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Tmc4Q7TQ65 694 aa20.33■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 TbcbQ9D1E6 244 aa20.33■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 A0A1L1SQF0 893 aa20.32■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Dhx8A2A4P0 1244 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 NcapgE9PWG6 1004 aa20.32■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Clca4aQ6Q473 924 aa20.32■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ccz1Q8C1Y8 480 aa20.32■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Cdan1Q8CC12 1239 aa20.32■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Lbhd1A0A087WPA0 259 aa20.32■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Sema3fO88632 785 aa20.32■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 SltmQ8CH25 1031 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Mmtag2Q99LX5 260 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Inpp4aQ9EPW0 939 aa20.32■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Zfp646Q6NV66 1788 aa20.31■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Gna11P21278 359 aa20.31■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 ErfeQ6PGN1 340 aa20.31■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Dnaaf4Q8R368 420 aa20.31■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Hs2st1Q8R3H7 356 aa20.31■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Brms1Q99N20 246 aa20.31■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Flvcr1B2RXV4 560 aa20.3■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Serpina16D3Z660 418 aa20.3■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Slc39a2G3X943 309 aa20.3■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 RdxP26043 583 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Gdf10P97737 476 aa20.3■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ube2oQ6ZPJ3 1288 aa20.3■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Enox1Q8BHR2 643 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Caps2Q8BUG5 550 aa20.3■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Atxn7Q8R4I1 867 aa20.3■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Mtmr9Q9Z2D0 545 aa20.3■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Dnai2A2AC93 623 aa20.3■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ptgs1P22437 602 aa20.3■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Tdo2P48776 406 aa20.3■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Slc10a5Q5PT54 434 aa20.3■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 WaplQ65Z40 1200 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Haus6Q6NV99 933 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ift74Q8BKE9 600 aa20.3■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Onecut3Q8K557 490 aa20.3■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ifi35Q9D8C4 286 aa20.3■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Arpp21Q9DCB4 807 aa20.3■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Psme4Q5SSW2 1843 aa20.3■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Myh7bA2AQP0 1941 aa20.3■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Plxnb2B2RXS4 1842 aa20.29■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Nek1P51954 1203 aa20.29■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 PsdQ5DTT2 1024 aa20.29■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Tnni3kQ5GIG6 834 aa20.29■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ankk1Q8BZ25 745 aa20.29■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Inpp5bQ8K337 993 aa20.29■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ciapin1Q8WTY4 309 aa20.29■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ppp2r5dQ91V89 594 aa20.29■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ttc5Q99LG4 440 aa20.29■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ccdc94Q9D6J3 314 aa20.29■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Cbx6Q9DBY5 414 aa20.29■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Dnajc25A2ALW5 357 aa20.29■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Pla2g4bP0C871 782 aa20.29■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Fdx1P46656 188 aa20.29■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ttbk2Q3UVR3 1243 aa20.29■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Gtf3c5Q8R2T8 520 aa20.29■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Mtfr1lQ9CWE0 289 aa20.29■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Palm3A2TJV2 734 aa20.28■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Fbln2P37889 1221 aa20.28■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Sap30bpQ02614 308 aa20.28■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Madcam1Q61826 405 aa20.28■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 CbarpQ66L44 698 aa20.28■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 GypcQ78HU7 95 aa20.28■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Asnsd1Q8BFS9 627 aa20.28■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Rasgrp4Q8BTM9 673 aa20.28■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Washc1Q8VDD8 475 aa20.28■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Rrp9Q91WM3 475 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Olfr247E9PVJ7 320 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ccdc85cE9Q6B2 420 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Olfr819K7N727 320 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Npr3P70180 536 aa20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.2 ms