RNA–Protein interactions for RNA: YOR328W

PDR10, Transcript of ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene PDR10, Length 4,695 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDR10	YOR328W	SAP4	P53036	818 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	ALR1	Q08269	859 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	IFM1	P25038	676 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	SFP1	P32432	683 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	IRC5	P43610	853 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	RMD8	P43620	662 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	TRS31	Q03337	283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	RPN4	Q03465	531 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	NSL1	Q12143	216 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	SAC7	P17121	654 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	GID7	P25569	745 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	AIM18	P38884	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	EMP65	P40085	556 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	TFB4	Q12004	338 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	LIP5	P32875	414 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	SDS22	P36047	338 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YHR131C	P38835	850 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	ZAP1	P47043	880 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	TEP1	P53916	434 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	DID2	P69771	204 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	BCP1	Q06338	283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	SEC15	P22224	910 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	SIF2	P38262	535 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	ERP2	P39704	215 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YCR015C	P25616	317 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	LHS1	P36016	881 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	ETR1	P38071	380 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	MRP21	P38175	177 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	ATG12	P38316	186 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	SFB3	P38810	929 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	ARP4	P80428	489 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	PET117	Q02771	107 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	SRL4	Q03085	281 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	RCO1	Q04779	684 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	SEC10	Q06245	871 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	PHO87	P25360	923 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	BUD14	P27637	709 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	RAD16	P31244	790 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	MRP4	P32902	394 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	CIN4	P39110	191 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	PAN6	P40459	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	YFL052W	P43551	465 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	GTR1	Q00582	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	HOT1	Q03213	719 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	TAF11	Q04226	346 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	YPR114W	Q06107	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	YLR177W	Q06251	628 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	RAD10	P06838	210 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	PMA2	P19657	947 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	POL4	P25615	582 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	COX13	P32799	129 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	SPC34	P36131	295 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	SPC97	P38863	823 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	ERR3	P42222	437 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	YTP1	P53584	459 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	TSA2	Q04120	196 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	RMP1	Q12530	201 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	TPK1	P06244	397 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	SYN8	P31377	255 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	CYM1	P32898	989 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	LRG1	P35688	1017 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	PHO89	P38361	574 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	SIP4	P46954	829 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	YNL143C	P53908	130 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	ARG7	Q04728	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	FRT1	Q99332	602 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	ECM25	P32525	599 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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