RNA–Protein interactions for RNA: YHL030W

ECM29, Transcript of Scaffold protein, yeast

Gene ECM29, Length 5,607 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECM29	YHL030W	ERC1	P38767	581 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	FHL1	P39521	936 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	PRM9	P39551	298 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SIT1	P39980	628 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YIL166C	P40445	542 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	PRK1	P40494	810 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SAE2	P46946	345 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	LOH1	P47055	219 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SNX41	Q04053	625 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YDR222W	Q04925	415 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	PSR1	Q07800	427 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	TCO89	Q08921	799 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	MHF2	Q3E829	80 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YHI9	P38765	294 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	IML2	P47031	731 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	CAF120	P53836	1060 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	NRT1	Q08485	598 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	TY3A-G	Q12173	290 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SVS1	Q12254	260 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	MDM12	Q92328	271 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	TY3A-I	Q99219	290 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	MED11	Q99278	115 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	TY2B-C	P25384	1770 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	RHO2	P06781	192 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	MRPL32	P25348	183 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	BEM1	P29366	551 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	ITR2	P30606	609 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	ARA1	P38115	344 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	FMC1	P40491	155 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YFR018C	P43599	363 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YJL055W	P47044	245 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	JAC1	P53193	184 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YDR239C	Q03780	787 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	INP2	Q03824	705 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	MCP2	Q06567	569 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	DDC1	Q08949	612 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	CAP2	P13517	287 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	ADY2	P25613	283 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	AST1	P35183	429 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	MLH1	P38920	769 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	HPM1	P40481	377 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YRB2	P40517	327 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SNX4	P47057	423 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YJR098C	P47139	656 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SIW14	P53965	281 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	MET31	Q03081	177 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	RAD33	Q04231	177 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	MDY2	Q12285	212 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YDR061W	Q12298	539 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YDL206W	Q12424	762 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	IME1	P21190	360 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	PRP28	P23394	588 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	APN2	P38207	520 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	STB1	P42845	420 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	MAD3	P47074	515 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	TAH11	P47112	604 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SPC98	P53540	846 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	NUP49	Q02199	472 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YPL107W	Q02873	248 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	HSP31	Q04432	237 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	OSW1	Q08692	278 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	NCR1	Q12200	1170 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	RTR2	Q12378	196 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	BI4	P03879	638 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	ABF1	P14164	731 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	TEC1	P18412	486 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SCJ1	P25303	377 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	DCC1	P25559	380 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	CIN8	P27895	1000 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97

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