RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637919.1

PLCB1-233, Transcript of phospholipase C beta 1, human

TSL 5 BASIC

Gene PLCB1, Length 5,074 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLCB1-233	ENST00000637919	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	EMB	Q6PCB8	327 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	KCNB2	Q92953	911 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	GGA2	Q9UJY4	613 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	N4BP3	O15049	544 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	MYZAP	P0CAP1	466 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	GBP1	P32455	592 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	GSTO1	P78417	241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	ATP11A	P98196	1134 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	SCRN1	Q12765	414 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	NECTIN1	Q15223	517 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	PSMD1	Q99460	953 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	ATG3	Q9NT62	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	SEMA3E	O15041	775 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	LARGE1	O95461	756 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	USP14	P54578	494 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	MTMR3	Q13615	1198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	FBF1	Q8TES7	1133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	LRRC45	Q96CN5	670 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	HOOK2	Q96ED9	719 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919		H0YIN7	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	PPP6R2	O75170	966 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	GPT	P24298	496 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	NNT	Q13423	1086 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	AKT1S1	Q96B36	256 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	NUP58	Q9BVL2	599 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	IRAK1	P51617	712 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	NDUFA8	P51970	172 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	GUCY1B3	Q02153	619 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	SEPT2	Q15019	361 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	MCM10	Q7L590	875 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	SLC35F6	Q8N357	371 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	PIM2	Q9P1W9	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919		E7EVH7	732 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	LDHC	P07864	332 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	SLC5A1	P13866	664 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	PFKFB1	P16118	471 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	RNF14	Q9UBS8	474 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	AK9	Q5TCS8	1911 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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