RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636280.1

DNM1-222, Transcript of dynamin 1, human

TSL 5

Gene DNM1, Length 2,462 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNM1-222	ENST00000636280	SCG2	P13521	617 aa		18.38	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	GNAQ	P50148	359 aa		18.38	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		18.38	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		18.38	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		18.38	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		18.38	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		18.38	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		18.37	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	SLC39A14	Q15043	492 aa		18.37	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		18.37	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	ADAL	Q6DHV7	355 aa		18.37	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	NIM1K	Q8IY84	436 aa		18.37	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		18.37	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	DNAJC18	Q9H819	358 aa		18.37	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	CAMK4	Q16566	473 aa		18.37	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		18.36	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	18.36	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	KLHL34	Q8N239	644 aa		18.36	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		18.36	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	CYTH3	O43739	400 aa		18.35	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	PTPA	Q15257	358 aa		18.35	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	NPY5R	Q15761	445 aa		18.35	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		18.35	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		18.35	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	FAM196B	A6NMK8	535 aa		18.35	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	FSIP1	Q8NA03	581 aa		18.35	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	18.35	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		18.35	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280		A0A1W2PQ27	194 aa		18.34	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280		A0A1W2PQ64	194 aa		18.34	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280		A0A1W2PQD8	194 aa		18.34	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		18.34	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	KLRF2	D3W0D1	207 aa		18.34	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	SPDYE6	P0CI01	402 aa		18.34	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	KRT2	P35908	639 aa		18.34	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		18.34	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	TNMD	Q9H2S6	317 aa		18.34	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		18.34	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	ESPN	B1AK53	854 aa		18.34	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	ENTPD3	O75355	529 aa		18.34	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	MAP3K11	Q16584	847 aa		18.34	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		18.34	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		18.34	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	OGFOD1	Q8N543	542 aa		18.34	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		18.34	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		18.34	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		18.34	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	CXCL9	Q07325	125 aa		18.33	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		18.33	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	CABP5	Q9NP86	173 aa		18.33	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	SIPA1L1	O43166	1804 aa		18.33	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	MYH8	P13535	1937 aa		18.33	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	TTLL1	O95922	423 aa		18.33	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		18.33	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	RNF214	Q8ND24	703 aa		18.33	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		18.33	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	CCDC17	Q96LX7	622 aa		18.33	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	CPVL	Q9H3G5	476 aa		18.33	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		18.33	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	FAM205C	A6NFA0	338 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	USP17L5	A8MUK1	530 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	NFKBIE	O00221	500 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	PPP6R2	O75170	966 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	PTGER2	P43116	358 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	DLGAP5	Q15398	846 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	18.32	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	BCS1L	Q9Y276	419 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280		A0A1B0GVL5	298 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	PDHB	P11177	359 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	NLRP5	P59047	1200 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	TNFRSF25	Q93038	417 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	JMY	Q8N9B5	988 aa		18.31	■□□□□ 0.52
DNM1-222	ENST00000636280	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		18.31	■□□□□ 0.52

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