RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP33.21■■■□□ 2.91
CAPNS1-217ENST00000629983 AACSQ86V21 672 aa33.21■■■□□ 2.91
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATC1LQ9H0A9 340 aa33.21■■■□□ 2.91
CAPNS1-217ENST00000629983 MCM9Q9NXL9 1143 aa33.21■■■□□ 2.91
CAPNS1-217ENST00000629983 STRNO43815 780 aa33.2■■■□□ 2.91
CAPNS1-217ENST00000629983 ERCC3P19447 782 aa33.2■■■□□ 2.91
CAPNS1-217ENST00000629983 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP33.2■■■□□ 2.91
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa33.2■■■□□ 2.91
CAPNS1-217ENST00000629983 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP33.2■■■□□ 2.91
CAPNS1-217ENST00000629983 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP33.2■■■□□ 2.91
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC5A4Q9NY91 659 aa33.2■■■□□ 2.91
CAPNS1-217ENST00000629983 SHHQ15465 462 aa33.19■■■□□ 2.9
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM60Q495X7 471 aa33.19■■■□□ 2.9
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PRG0 241 aa33.18■■■□□ 2.9
CAPNS1-217ENST00000629983 SEPT4O43236 478 aa33.18■■■□□ 2.9
CAPNS1-217ENST00000629983 NCAPG2Q86XI2 1143 aa33.18■■■□□ 2.9
CAPNS1-217ENST00000629983 SHCBP1Q8NEM2 672 aa33.18■■■□□ 2.9
CAPNS1-217ENST00000629983 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa33.17■■■□□ 2.9
CAPNS1-217ENST00000629983 COBLO75128 1261 aa33.16■■■□□ 2.9
CAPNS1-217ENST00000629983 EVX2Q03828 476 aa33.16■■■□□ 2.9
CAPNS1-217ENST00000629983 GABPAQ06546 454 aa33.16■■■□□ 2.9
CAPNS1-217ENST00000629983 C9orf50Q5SZB4 431 aa33.16■■■□□ 2.9
CAPNS1-217ENST00000629983 BADQ92934 168 aa33.16■■■□□ 2.9
CAPNS1-217ENST00000629983 FERMT2Q96AC1 680 aa33.16■■■□□ 2.9
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHA2P01877 340 aa33.15■■■□□ 2.9
CAPNS1-217ENST00000629983 ADCYAP1R1P41586 468 aa33.15■■■□□ 2.9
CAPNS1-217ENST00000629983 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP33.15■■■□□ 2.9
CAPNS1-217ENST00000629983 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa33.15■■■□□ 2.9
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa33.15■■■□□ 2.9
CAPNS1-217ENST00000629983 ERC1Q8IUD2 1116 aa33.15■■■□□ 2.9
CAPNS1-217ENST00000629983 MB21D1Q8N884 522 aa33.15■■■□□ 2.9
CAPNS1-217ENST00000629983 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP33.15■■■□□ 2.9
CAPNS1-217ENST00000629983 FLOT1O75955 427 aa33.14■■■□□ 2.9
CAPNS1-217ENST00000629983 PDE6AP16499 860 aa33.14■■■□□ 2.9
CAPNS1-217ENST00000629983 MROH8Q9H579 483 aa33.14■■■□□ 2.9
CAPNS1-217ENST00000629983 CCER2I3L3R5 266 aa33.13■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM179Q6ZVK1 233 aa33.13■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 SDR42E1Q8WUS8 393 aa33.13■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 PDLIM7Q9NR12 457 aa33.13■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 DSG3P32926 999 aa33.12■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC41Q15345 812 aa33.12■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM47AQ5JRC9 791 aa33.12■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 SPICE1Q8N0Z3 855 aa33.12■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC44A5Q8NCS7 719 aa33.12■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP33.12■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 ATG4CQ96DT6 458 aa33.12■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa33.12■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa33.12■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF532Q9HCE3 1301 aa33.11■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP2D6P10635 497 aa33.11■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 CEP85Q6P2H3 762 aa33.11■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP33.11■■■□□ 2.89
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CAPNS1-217ENST00000629983 FCER1AP12319 257 aa33.1■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 ICA1Q05084 483 aa33.1■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa33.1■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa33.1■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 CLEC10AQ8IUN9 316 aa33.1■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 MAML3Q96JK9 1138 aa33.1■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 SH2D4AQ9H788 454 aa33.1■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF236Q9UL36 1845 aa33.09■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 SNX17Q15036 470 aa33.09■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 ABRAQ8N0Z2 381 aa33.09■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 LCORLQ8N3X6 602 aa33.09■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 DYNLL2Q96FJ2 89 aa33.09■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP33.09■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 SWAP70Q9UH65 585 aa33.09■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 UNC80Q8N2C7 3258 aa33.08■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 NAV1Q8NEY1 1877 aa33.08■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 LTBP2Q14767 1821 aa33.08■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 RLBP1P12271 317 aa33.08■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 MYLIPQ8WY64 445 aa33.08■■■□□ 2.89
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM43BA6NCK2 446 aa33.07■■■□□ 2.88
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLIM4O00461 696 aa33.07■■■□□ 2.88
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CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP33.07■■■□□ 2.88
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CAPNS1-217ENST00000629983 AKR1B1P15121 316 aa33.06■■■□□ 2.88
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CAPNS1-217ENST00000629983 TMX2Q9Y320 296 aa33.05■■■□□ 2.88
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A27O95847 323 aa33.04■■■□□ 2.88
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CAPNS1-217ENST00000629983 RHPN1Q8TCX5 695 aa33.04■■■□□ 2.88
CAPNS1-217ENST00000629983 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR46O15213 610 aaKnown RBP33.03■■■□□ 2.88
CAPNS1-217ENST00000629983 RAD21O60216 631 aa33.03■■■□□ 2.88
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM132BQ14DG7 1078 aa33.03■■■□□ 2.88
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF180Q86T96 592 aa33.03■■■□□ 2.88
CAPNS1-217ENST00000629983 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP33.03■■■□□ 2.88
CAPNS1-217ENST00000629983 PHF24Q9UPV7 400 aa33.03■■■□□ 2.88
CAPNS1-217ENST00000629983 TACC3Q9Y6A5 838 aa33.03■■■□□ 2.88
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0G2JMZ2 1700 aa33.02■■■□□ 2.88
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