RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 PAG1Q9NWQ8 432 aa30.13■■■□□ 2.41
PTPRF-216ENST00000617451 SWAP70Q9UH65 585 aa30.13■■■□□ 2.41
PTPRF-216ENST00000617451 ATP2B2Q01814 1243 aa30.12■■■□□ 2.41
PTPRF-216ENST00000617451 NPLOC4Q8TAT6 608 aa30.12■■■□□ 2.41
PTPRF-216ENST00000617451 BCL11AQ9H165 835 aa30.12■■■□□ 2.41
PTPRF-216ENST00000617451 ADD2P35612 726 aa30.11■■■□□ 2.41
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC26Q2I0M4 334 aa30.11■■■□□ 2.41
PTPRF-216ENST00000617451 DYNLL2Q96FJ2 89 aa30.11■■■□□ 2.41
PTPRF-216ENST00000617451 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
PTPRF-216ENST00000617451 TANGO6Q9C0B7 1094 aa30.11■■■□□ 2.41
PTPRF-216ENST00000617451 BOLA2Q9H3K6 86 aa30.11■■■□□ 2.41
PTPRF-216ENST00000617451 PRKAB2O43741 272 aa30.1■■■□□ 2.41
PTPRF-216ENST00000617451 IGHA2P01877 340 aa30.1■■■□□ 2.41
PTPRF-216ENST00000617451 ATP5JP18859 108 aa30.1■■■□□ 2.41
PTPRF-216ENST00000617451 SLFNL1Q499Z3 407 aa30.1■■■□□ 2.41
PTPRF-216ENST00000617451 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa30.1■■■□□ 2.41
PTPRF-216ENST00000617451 SIAH1Q8IUQ4 282 aa30.1■■■□□ 2.41
PTPRF-216ENST00000617451 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa30.1■■■□□ 2.41
PTPRF-216ENST00000617451 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
PTPRF-216ENST00000617451 CYP2C19P33261 490 aa30.09■■■□□ 2.41
PTPRF-216ENST00000617451 SPATC1LQ9H0A9 340 aa30.09■■■□□ 2.41
PTPRF-216ENST00000617451 STRNO43815 780 aa30.08■■■□□ 2.41
PTPRF-216ENST00000617451 MSCO60682 206 aa30.08■■■□□ 2.41
PTPRF-216ENST00000617451 MBD4O95243 580 aa30.08■■■□□ 2.41
PTPRF-216ENST00000617451 GPR153Q6NV75 609 aa30.08■■■□□ 2.41
PTPRF-216ENST00000617451 LPAR1Q92633 364 aa30.08■■■□□ 2.41
PTPRF-216ENST00000617451 HAUS7Q99871 368 aa30.08■■■□□ 2.41
PTPRF-216ENST00000617451 RLFQ13129 1914 aa30.07■■■□□ 2.4
PTPRF-216ENST00000617451 AKR1B1P15121 316 aa30.07■■■□□ 2.4
PTPRF-216ENST00000617451 LRIT3Q3SXY7 679 aa30.07■■■□□ 2.4
PTPRF-216ENST00000617451 DPP9Q86TI2 863 aa30.07■■■□□ 2.4
PTPRF-216ENST00000617451 TDHQ8IZJ6 230 aa30.07■■■□□ 2.4
PTPRF-216ENST00000617451 MB21D1Q8N884 522 aa30.07■■■□□ 2.4
PTPRF-216ENST00000617451 SHCBP1Q8NEM2 672 aa30.07■■■□□ 2.4
PTPRF-216ENST00000617451 TRPV1Q8NER1 839 aa30.07■■■□□ 2.4
PTPRF-216ENST00000617451 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP30.07■■■□□ 2.44e-8■■■□□ 16.3
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PTPRF-216ENST00000617451 ADORA2AP29274 412 aa30.06■■■□□ 2.4
PTPRF-216ENST00000617451 CNGA1P29973 690 aa30.06■■■□□ 2.4
PTPRF-216ENST00000617451 C12orf60Q5U649 245 aa30.06■■■□□ 2.4
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PTPRF-216ENST00000617451 ERCC3P19447 782 aa30.05■■■□□ 2.4
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PTPRF-216ENST00000617451 ICA1Q05084 483 aa30.05■■■□□ 2.4
PTPRF-216ENST00000617451 OLFML2BQ68BL8 750 aa30.05■■■□□ 2.4
PTPRF-216ENST00000617451 CLEC10AQ8IUN9 316 aa30.05■■■□□ 2.4
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC17Q96LX7 622 aa30.05■■■□□ 2.4
PTPRF-216ENST00000617451 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
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PTPRF-216ENST00000617451 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa30.04■■■□□ 2.4
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PTPRF-216ENST00000617451 CYBAP13498 195 aa30.04■■■□□ 2.4
PTPRF-216ENST00000617451 UBE3CQ15386 1083 aa30.04■■■□□ 2.4
PTPRF-216ENST00000617451 SH2D4AQ9H788 454 aa30.04■■■□□ 2.4
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PTPRF-216ENST00000617451 A0A0G2JMZ2 1700 aa30.04■■■□□ 2.4
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PTPRF-216ENST00000617451 USP17L21D6R901 530 aa30.03■■■□□ 2.4
PTPRF-216ENST00000617451 FLOT1O75955 427 aa30.03■■■□□ 2.4
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PTPRF-216ENST00000617451 SPICE1Q8N0Z3 855 aa30.03■■■□□ 2.4
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PTPRF-216ENST00000617451 COBLO75128 1261 aa30.02■■■□□ 2.4
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PTPRF-216ENST00000617451 MROH8Q9H579 483 aa30.02■■■□□ 2.4
PTPRF-216ENST00000617451 MYH8P13535 1937 aa30.01■■■□□ 2.39
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PTPRF-216ENST00000617451 C16orf86Q6ZW13 317 aa30.01■■■□□ 2.39
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PTPRF-216ENST00000617451 DDRGK1Q96HY6 314 aa30■■■□□ 2.39
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PTPRF-216ENST00000617451 LRRCC1Q9C099 1032 aa29.99■■■□□ 2.39
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PTPRF-216ENST00000617451 RCAN3Q9UKA8 241 aa29.99■■■□□ 2.39
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PTPRF-216ENST00000617451 DEFB123Q8N688 67 aa29.98■■■□□ 2.39
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PTPRF-216ENST00000617451 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa29.98■■■□□ 2.39
PTPRF-216ENST00000617451 SEPT4O43236 478 aa29.97■■■□□ 2.39
PTPRF-216ENST00000617451 EEF2P13639 858 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM132BQ14DG7 1078 aa29.97■■■□□ 2.39
PTPRF-216ENST00000617451 CTR9Q6PD62 1173 aa29.97■■■□□ 2.39
PTPRF-216ENST00000617451 ARRDC4Q8NCT1 418 aa29.97■■■□□ 2.39
PTPRF-216ENST00000617451 SLC17A8Q8NDX2 589 aa29.97■■■□□ 2.39
PTPRF-216ENST00000617451 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
PTPRF-216ENST00000617451 MYH7P12883 1935 aa29.95■■■□□ 2.39
PTPRF-216ENST00000617451 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
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