RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610454.4

SENP3-209, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

TSL 3

Gene SENP3, Length 606 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-209ENST00000610454 CCDC171Q6TFL3 1326 aa15.93■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 PRDM1O75626 825 aa15.92■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 TSPY3P0CV98 308 aa15.92■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 TSPY8P0CW00 308 aa15.92■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 FLT3LGP49771 235 aa15.92■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 ERVK-9P63128 1117 aa15.92■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 ERVK-24P63145 666 aa15.92■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 SPICE1Q8N0Z3 855 aa15.92■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 SLAIN1Q8ND83 568 aa15.92■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 ZNF333Q96JL9 665 aa15.92■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa15.92■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 WDR46O15213 610 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 MYCP01106 439 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 MAPK4P31152 587 aa15.91■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 RGS19P49795 217 aa15.91■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 UBXN2AP68543 259 aa15.91■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 VPS53Q5VIR6 699 aa15.91■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 TXNRD2Q9NNW7 524 aa15.91■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 HOXC10Q9NYD6 342 aa15.91■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 GABRQQ9UN88 632 aa15.91■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 MYH4Q9Y623 1939 aa15.91■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 TSPY2A6NKD2 308 aa15.9■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 ADCY3O60266 1144 aa15.9■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 FLOT1O75955 427 aa15.9■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 COG2Q14746 738 aa15.9■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 ALX1Q15699 326 aa15.9■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa15.9■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 TTC22Q5TAA0 569 aa15.9■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 WDR78Q5VTH9 848 aa15.9■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 TOMM22Q9NS69 142 aa15.9■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 NYAP2Q9P242 653 aa15.9■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 RBPJLQ9UBG7 517 aa15.9■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 DOCK3Q8IZD9 2030 aa15.9■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SENP3-209ENST00000610454 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 PDE4AP27815 886 aa15.89■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 TFAP4Q01664 338 aa15.89■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 CTDSPL2Q05D32 466 aa15.89■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 IRF5Q13568 498 aa15.89■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 LBX2Q6XYB7 198 aa15.89■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 SIAH1Q8IUQ4 282 aa15.89■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 SOCS4Q8WXH5 440 aa15.89■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 CLIP2Q9UDT6 1046 aa15.89■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 FOXP2O15409 715 aa15.88■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 TTLL1O95922 423 aa15.88■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 FGAP02671 866 aa15.88■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 MB21D1Q8N884 522 aa15.88■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 CEP95Q96GE4 821 aa15.88■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 NUDT12Q9BQG2 462 aa15.88■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 ANAPC4Q9UJX5 808 aa15.88■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa15.88■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 ZMYM6O95789 1325 aa15.88■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 PLIN4Q96Q06 1357 aa15.87■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 PEX10O60683 326 aa15.87■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 PLS1Q14651 629 aa15.87■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 FAM47AQ5JRC9 791 aa15.87■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa15.87■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 PLEKHH3Q7Z736 793 aa15.87■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 NEDD1Q8NHV4 660 aa15.87■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 PXYLP1Q8TE99 480 aa15.87■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 MTMR4Q9NYA4 1195 aa15.87■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 POTEFA5A3E0 1075 aa15.86■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 NEFLP07196 543 aa15.86■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 ELNP15502 786 aa15.86■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 DSG3P32926 999 aa15.86■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 Q3C1V9 767 aa15.86■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 FAM83BQ5T0W9 1011 aa15.86■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 GPR142Q7Z601 462 aa15.86■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 RUFY2Q8WXA3 655 aa15.86■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 PORCNQ9H237 461 aa15.86■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa15.86■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 STX8Q9UNK0 236 aa15.86■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP15.86■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 A0A0G2JMZ2 1700 aa15.85■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 PARP14Q460N5 1801 aa15.85■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa15.85■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 F5H6K3 240 aa15.85■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 ORC4O43929 436 aa15.85■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 CNMDO75829 334 aa15.85■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 INHAP05111 366 aa15.85■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 PCP11498 1178 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 RGS2P41220 211 aa15.85■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 HAND2P61296 217 aa15.85■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 KLRC3Q07444 240 aa15.85■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 ATG4CQ96DT6 458 aa15.85■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 RNF208Q9H0X6 261 aa15.85■□□□□ 0.13
SENP3-209ENST00000610454 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms