RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PCP11498 1178 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRDM10Q9NQV6 1147 aa13.41□□□□□ -0.26
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TC2NQ8N9U0 490 aa13.4□□□□□ -0.26
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CPLX3Q8WVH0 158 aa13.4□□□□□ -0.26
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LEMD3Q9Y2U8 911 aa13.4□□□□□ -0.26
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PP2D1A8MPX8 630 aa13.4□□□□□ -0.26
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa13.4□□□□□ -0.26
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 E2F4Q16254 413 aa13.4□□□□□ -0.26
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa13.4□□□□□ -0.26
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DGKHQ86XP1 1220 aa13.4□□□□□ -0.26
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CREBRFQ8IUR6 639 aa13.4□□□□□ -0.26
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLIN2Q99541 437 aa13.4□□□□□ -0.26
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BAG3O95817 575 aa13.4□□□□□ -0.27
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BMP15O95972 392 aa13.4□□□□□ -0.27
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.27
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