RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.49■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 SLAIN1Q8ND83 568 aa20.49■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa20.49■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 VCPKMTQ9H867 229 aa20.49■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.49■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 GRK4P32298 578 aa20.48■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 ERVK-9P63128 1117 aa20.48■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 ERVK-24P63145 666 aa20.48■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 PDE4BQ07343 736 aa20.48■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 PPARAQ07869 468 aa20.48■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 ALX1Q15699 326 aa20.48■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 RILPL2Q969X0 211 aa20.48■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 GABRQQ9UN88 632 aa20.48■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.48■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa20.47■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 WDR46O15213 610 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 SDSP20132 328 aa20.47■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 PDE4AP27815 886 aa20.47■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 FLT3LGP49771 235 aa20.47■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 VPS53Q5VIR6 699 aa20.47■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 PXYLP1Q8TE99 480 aa20.47■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.47■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 ANAPC4Q9UJX5 808 aa20.47■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.47■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 HIP1O00291 1037 aa20.46■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 MAPK4P31152 587 aa20.46■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.46■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 NYAP2Q9P242 653 aa20.46■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 CNMDO75829 334 aa20.45■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.45■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 TANGO6Q9C0B7 1094 aa20.45■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 GOPCQ9HD26 462 aa20.45■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa20.44■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 ADCY3O60266 1144 aa20.44■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 PRDM1O75626 825 aa20.44■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 CCNA1P78396 465 aa20.44■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 COG2Q14746 738 aa20.44■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 STK11IPQ8N1F8 1099 aa20.44■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 NEDD1Q8NHV4 660 aa20.44■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 SOCS4Q8WXH5 440 aa20.44■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.44■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 HOXC10Q9NYD6 342 aa20.44■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 POTEFA5A3E0 1075 aa20.43■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 PEX10O60683 326 aa20.43■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 ATP2B2Q01814 1243 aa20.43■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 Q3C1V9 767 aa20.43■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 TTC22Q5TAA0 569 aa20.43■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 SPICE1Q8N0Z3 855 aa20.43■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 MB21D1Q8N884 522 aa20.43■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.43■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 PORCNQ9H237 461 aa20.43■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 GJD2Q9UKL4 321 aa20.43■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 FGRP09769 529 aa20.42■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 TSPY3P0CV98 308 aa20.42■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 TSPY8P0CW00 308 aa20.42■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 MKL1Q969V6 931 aa20.42■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 CEP95Q96GE4 821 aa20.42■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.42■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 BTBD7Q9P203 1132 aa20.42■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 FRMPD3Q5JV73 1810 aa20.41■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 ORC4O43929 436 aa20.41■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 FLOT1O75955 427 aa20.41■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 FGAP02671 866 aa20.41■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 DSG3P32926 999 aa20.41■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 UBXN2AP68543 259 aa20.41■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.41■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 GPR142Q7Z601 462 aa20.41■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 TTLL1O95922 423 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 ELNP15502 786 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 PLEKHH3Q7Z736 793 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 USP6NLQ92738 828 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.4■□□□□ 0.86
HERC3-214ENST00000601319 INHAP05111 366 aa20.39■□□□□ 0.85
HERC3-214ENST00000601319 PCP11498 1178 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
HERC3-214ENST00000601319 TFAP4Q01664 338 aa20.39■□□□□ 0.85
HERC3-214ENST00000601319 MTFR1Q15390 333 aa20.39■□□□□ 0.85
HERC3-214ENST00000601319 MORN1Q5T089 497 aa20.39■□□□□ 0.85
HERC3-214ENST00000601319 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
HERC3-214ENST00000601319 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.39■□□□□ 0.85
HERC3-214ENST00000601319 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.39■□□□□ 0.85
HERC3-214ENST00000601319 RAD50Q92878 1312 aa20.38■□□□□ 0.85
HERC3-214ENST00000601319 F5H6K3 240 aa20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms