RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 COL6A3P12111 3177 aa31.06■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 COG2Q14746 738 aa31.05■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 LPAR1Q92633 364 aa31.05■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 TANGO6Q9C0B7 1094 aa31.05■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 MSCO60682 206 aa31.04■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 CYBAP13498 195 aa31.04■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF1BPQ96EK5 621 aa31.04■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 ADORA2AP29274 412 aa31.03■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 SLFNL1Q499Z3 407 aa31.03■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM179Q6ZVK1 233 aa31.03■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 CLEC10AQ8IUN9 316 aa31.03■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 DYNLL2Q96FJ2 89 aa31.03■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATC1LQ9H0A9 340 aa31.03■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 ARMT1Q9H993 441 aa31.03■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXC10Q9NYD6 342 aa31.03■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0G2JMZ2 1700 aa31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 DNM1LO00429 736 aa31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 DLL1O00548 723 aa31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 DPP9Q86TI2 863 aa31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 BCL11AQ9H165 835 aa31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF236Q9UL36 1845 aa31.01■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKAB2O43741 272 aa31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 ERCC3P19447 782 aa31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 SIAH1Q8IUQ4 282 aa31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 SIRT2Q8IXJ6 389 aa31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 MIER1Q8N108 512 aa31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 MTMR10Q9NXD2 777 aa31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 SWAP70Q9UH65 585 aa31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 AKR1B1P15121 316 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 OLFML2BQ68BL8 750 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 SHCBP1Q8NEM2 672 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 SMIM22K7EJ46 135 aa30.99■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 STRNO43815 780 aa30.99■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 COBLO75128 1261 aa30.99■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 RLFQ13129 1914 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 MBD4O95243 580 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 DSG3P32926 999 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 ADD2P35612 726 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 SPICE1Q8N0Z3 855 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 PAG1Q9NWQ8 432 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 ICA1Q05084 483 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 ANO1Q5XXA6 986 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 MB21D1Q8N884 522 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 ATG4CQ96DT6 458 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 BOLA2Q9H3K6 86 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 TMX2Q9Y320 296 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBED9Q6R2W3 1325 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 FLOT1O75955 427 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 CHGBP05060 677 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 RTP1P59025 263 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 PLS1Q14651 629 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 HMMRO75330 724 aa30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 NCAPG2Q86XI2 1143 aa30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 VCPKMTQ9H867 229 aa30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 COG6Q9Y2V7 657 aa30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-211ENST00000590874 MROH8Q9H579 483 aa30.94■■■□□ 2.54
CAPNS1-211ENST00000590874 SEPT4O43236 478 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB11FIP3O75154 756 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-211ENST00000590874 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-211ENST00000590874 C12orf60Q5U649 245 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-211ENST00000590874 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-211ENST00000590874 ARRDC4Q8NCT1 418 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-211ENST00000590874 SH2D4AQ9H788 454 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-211ENST00000590874 MS4A1P11836 297 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP5JP18859 108 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-211ENST00000590874 CDK8P49336 464 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-211ENST00000590874 ABRAQ8N0Z2 381 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX19BQ9UMR2 479 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-211ENST00000590874 USP17L12C9JPN9 530 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-211ENST00000590874 USP17L21D6R901 530 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR46O15213 610 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM132BQ14DG7 1078 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-211ENST00000590874 MAML3Q96JK9 1138 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC17Q96LX7 622 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-211ENST00000590874 HAUS7Q99871 368 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-211ENST00000590874 KBTBD13C9JR72 458 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-211ENST00000590874 C16orf86Q6ZW13 317 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP30.9■■■□□ 2.542e-6■■□□□ 12.4
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC5A4Q9NY91 659 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAH12Q6ZR08 3092 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-211ENST00000590874 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-211ENST00000590874 POTEB2H3BUK9 544 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 FCER1AP12319 257 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 EEF2P13639 858 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO28Q9NVF7 368 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms