RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589497.5

GIPC1-210, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene GIPC1, Length 853 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-210ENST00000589497 TOMM22Q9NS69 142 aa22.45■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.45■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 FGAP02671 866 aa22.44■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 TFAP4Q01664 338 aa22.44■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 PRKCZQ05513 592 aa22.44■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 COG2Q14746 738 aa22.44■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.44■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.44■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.44■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 TSPY2A6NKD2 308 aa22.43■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 CCNA1P78396 465 aa22.43■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.43■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.43■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 NYAP2Q9P242 653 aa22.43■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.43■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.43■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 ERVK-9P63128 1117 aa22.42■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 ERVK-24P63145 666 aa22.42■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.42■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 FOXP2O15409 715 aa22.41■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 FLOT1O75955 427 aa22.41■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 FLT3LGP49771 235 aa22.41■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 WDR78Q5VTH9 848 aa22.41■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.41■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.41■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.41■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 ARMC5Q96C12 935 aa22.41■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.41■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.41■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 GABRQQ9UN88 632 aa22.41■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF213O14771 459 aa22.4■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 PEX10O60683 326 aa22.4■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 TTLL1O95922 423 aa22.4■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 MAPK4P31152 587 aa22.4■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 GRK4P32298 578 aa22.4■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 Q3C1V9 767 aa22.4■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 CEP95Q96GE4 821 aa22.4■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.4■■□□□ 1.18
GIPC1-210ENST00000589497 HAND2P61296 217 aa22.39■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 UBXN2AP68543 259 aa22.39■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.39■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.39■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 INCENPQ9NQS7 918 aa22.39■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.39■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 F5H6K3 240 aa22.38■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 ADCY3O60266 1144 aa22.38■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 KLRC3Q07444 240 aa22.38■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.38■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF333Q96JL9 665 aa22.38■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.38■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 ZMYM6O95789 1325 aa22.37■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.37■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 DSG3P32926 999 aa22.37■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 PLS1Q14651 629 aa22.37■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 LBX2Q6XYB7 198 aa22.37■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 MB21D1Q8N884 522 aa22.37■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.37■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 STX8Q9UNK0 236 aa22.37■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.36■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 IRF5Q13568 498 aa22.36■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.36■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.36■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 MKL1Q969V6 931 aa22.36■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.36■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 ORC4O43929 436 aa22.35■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.35■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.35■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.35■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.35■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 PORCNQ9H237 461 aa22.35■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 BTBD7Q9P203 1132 aa22.35■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.35■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 CNMDO75829 334 aa22.34■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 NDUFB10O96000 172 aa22.34■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 CYP2B6P20813 491 aa22.34■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 RGS19P49795 217 aa22.34■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 SLFN13Q68D06 897 aa22.34■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 GPR142Q7Z601 462 aa22.34■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 ATG4CQ96DT6 458 aa22.34■■□□□ 1.17
GIPC1-210ENST00000589497 MGAMO43451 1857 aa22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.1 ms