RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 TMX2Q9Y320 296 aa8.07□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 ROBO3Q96MS0 1386 aa8.07□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 TSPY2A6NKD2 308 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 USP17L15C9J2P7 530 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 USP17L11C9JVI0 530 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 USP17L18D6R9N7 530 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 USP17L22D6RA61 530 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 USP17L19D6RCP7 530 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 USP17L20D6RJB6 530 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 SGSM2O43147 1006 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 NMT2O60551 498 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 PEX10O60683 326 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 CAP1Q01518 475 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 USP17L24Q0WX57 530 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 BMP2KLQ5H9B9 411 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 AKNAD1Q5T1N1 836 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 SPICE1Q8N0Z3 855 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 NEDD1Q8NHV4 660 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 CEP95Q96GE4 821 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 DCBLD2Q96PD2 775 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 MCOLN1Q9GZU1 580 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 NBPF3Q9H094 633 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 EFCC1Q9HA90 598 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 NYAP2Q9P242 653 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 CTNNA3Q9UI47 895 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 PNMA3Q9UL41 463 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 TRIM17Q9Y577 477 aa8.06□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 F5H6K3 240 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 FGRP09769 529 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 BCRP11274 1271 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 VCAM1P19320 739 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 PSMC4P43686 418 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 HERVK_113P62684 666 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 KLRC3Q07444 240 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGEF6Q15052 776 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 Q3C1V9 767 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 OTOP1Q7RTM1 612 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 C12orf42Q96LP6 360 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 PAGR1Q9BTK6 254 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 TANGO6Q9C0B7 1094 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 SH2D4AQ9H788 454 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 VCPKMTQ9H867 229 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 GOPCQ9HD26 462 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 IL17RBQ9NRM6 502 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 MTMR4Q9NYA4 1195 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 RBPJLQ9UBG7 517 aa8.05□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 ZMYM6O95789 1325 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 RAD50Q92878 1312 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 ADGRA2Q96PE1 1338 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 ORC4O43929 436 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 TTLL1O95922 423 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 CTGFP29279 349 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 COG2Q14746 738 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM83BQ5T0W9 1011 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 TBC1D10CQ8IV04 446 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 STAG1Q8WVM7 1258 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 MAP4K1Q92918 833 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 MKL1Q969V6 931 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 TRIM47Q96LD4 638 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 HOXC10Q9NYD6 342 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 STX8Q9UNK0 236 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 MTMR7Q9Y216 660 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 PTPN22Q9Y2R2 807 aa8.04□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 LAMA4Q16363 1823 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 B4E1Z4 1266 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 KDM4AO75164 1064 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 CDC45O75419 566 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 FLOT1O75955 427 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 SLFN13Q68D06 897 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 POTEEQ6S8J3 1075 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 CASC1Q6TDU7 716 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 LPAR1Q92633 364 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-211ENST00000588374 ESR2Q92731 530 aa8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 387.6 ms