RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580814.1

TSG101-211, Transcript of tumor susceptibility 101, humanhuman

TSL 2

Gene TSG101, Length 441 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101-211ENST00000580814 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.48□□□□□ -1.05
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TSG101-211ENST00000580814 CCDC113Q9H0I3 377 aa8.48□□□□□ -1.05
TSG101-211ENST00000580814 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
TSG101-211ENST00000580814 MSRB2Q9Y3D2 182 aa8.48□□□□□ -1.05
TSG101-211ENST00000580814 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa8.48□□□□□ -1.05
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TSG101-211ENST00000580814 ATG3Q9NT62 314 aa8.47□□□□□ -1.05
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TSG101-211ENST00000580814 KIAA1211LQ6NV74 962 aa8.45□□□□□ -1.06
TSG101-211ENST00000580814 PPFIBP1Q86W92 1011 aa8.45□□□□□ -1.06
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TSG101-211ENST00000580814 C9IYK1 514 aa8.44□□□□□ -1.06
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TSG101-211ENST00000580814 NBPF9Q3BBW0 867 aa8.44□□□□□ -1.06
TSG101-211ENST00000580814 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa8.44□□□□□ -1.06
TSG101-211ENST00000580814 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa8.44□□□□□ -1.06
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TSG101-211ENST00000580814 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
TSG101-211ENST00000580814 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
TSG101-211ENST00000580814 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa8.43□□□□□ -1.06
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TSG101-211ENST00000580814 KCNH3Q9ULD8 1083 aa8.43□□□□□ -1.06
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TSG101-211ENST00000580814 OXCT1P55809 520 aa8.42□□□□□ -1.06
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TSG101-211ENST00000580814 SNTG2Q9NY99 539 aa8.41□□□□□ -1.06
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TSG101-211ENST00000580814 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa8.4□□□□□ -1.06
TSG101-211ENST00000580814 KLHL25Q9H0H3 589 aa8.4□□□□□ -1.06
TSG101-211ENST00000580814 PIF1Q9H611 641 aa8.4□□□□□ -1.06
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TSG101-211ENST00000580814 CYP26A1O43174 497 aa8.39□□□□□ -1.07
TSG101-211ENST00000580814 CBFA2T2O43439 604 aa8.39□□□□□ -1.07
TSG101-211ENST00000580814 FOSL1P15407 271 aa8.39□□□□□ -1.07
TSG101-211ENST00000580814 CD247P20963 164 aa8.39□□□□□ -1.07
TSG101-211ENST00000580814 TNK2Q07912 1038 aa8.39□□□□□ -1.07
TSG101-211ENST00000580814 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TSG101-211ENST00000580814 PRSS36Q5K4E3 855 aa8.39□□□□□ -1.07
TSG101-211ENST00000580814 DCAF15Q66K64 600 aa8.39□□□□□ -1.07
TSG101-211ENST00000580814 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TSG101-211ENST00000580814 APBA2Q99767 749 aa8.39□□□□□ -1.07
TSG101-211ENST00000580814 SEMA6BQ9H3T3 888 aa8.39□□□□□ -1.07
TSG101-211ENST00000580814 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa8.39□□□□□ -1.07
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