RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566635.5

HERC2-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HERC2, Length 2,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-208ENST00000566635 ATP2B2Q01814 1243 aa20.54■□□□□ 0.88
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HERC2-208ENST00000566635 MAP3K14Q99558 947 aa20.54■□□□□ 0.88
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HERC2-208ENST00000566635 SEPT2Q15019 361 aa20.54■□□□□ 0.88
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HERC2-208ENST00000566635 UBA5Q9GZZ9 404 aa20.45■□□□□ 0.86
HERC2-208ENST00000566635 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
HERC2-208ENST00000566635 SSC5DA1L4H1 1573 aa20.44■□□□□ 0.86
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HERC2-208ENST00000566635 ECE1P42892 770 aa20.44■□□□□ 0.86
HERC2-208ENST00000566635 KCTD1Q719H9 257 aa20.44■□□□□ 0.86
HERC2-208ENST00000566635 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
HERC2-208ENST00000566635 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.86
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