RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566243.5

EDC3-211, Transcript of enhancer of mRNA decapping 3, humanhuman

TSL 3

Gene EDC3, Length 711 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3-211ENST00000566243 ZMYM6O95789 1325 aa22.67■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 PRMT2P55345 433 aa22.67■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 PRKCZQ05513 592 aa22.67■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.67■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 LPAR1Q92633 364 aa22.67■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 MYPNQ86TC9 1320 aa22.66■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 CNMDO75829 334 aa22.66■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 HOXD10P28358 340 aa22.66■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 TFAP4Q01664 338 aa22.66■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 Q3C1V9 767 aa22.66■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.66■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 ARMC5Q96C12 935 aa22.66■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 CEP95Q96GE4 821 aa22.66■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.66■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 NYAP2Q9P242 653 aa22.66■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 GABRQQ9UN88 632 aa22.66■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 CENPFP49454 3210 aa22.65■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.65■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 FGRP09769 529 aa22.65■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 TSPY3P0CV98 308 aa22.65■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 TSPY8P0CW00 308 aa22.65■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 HAND2P61296 217 aa22.65■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.65■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 NBPF3Q9H094 633 aa22.65■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.65■■□□□ 1.22
EDC3-211ENST00000566243 SOX10P56693 466 aa22.64■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 ERVK-9P63128 1117 aa22.64■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 ERVK-24P63145 666 aa22.64■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 LBX2Q6XYB7 198 aa22.64■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.64■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.64■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 ORC4O43929 436 aa22.63■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 CHMLP26374 656 aa22.63■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 COG2Q14746 738 aa22.63■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.63■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 RAET1EQ8TD07 263 aa22.63■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 GOPCQ9HD26 462 aa22.63■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 BTBD7Q9P203 1132 aa22.63■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.63■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 RAD21O60216 631 aa22.62■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 FLT3LGP49771 235 aa22.62■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.62■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 MKL1Q969V6 931 aa22.62■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 COA7Q96BR5 231 aa22.62■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 ZNF333Q96JL9 665 aa22.62■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 PORCNQ9H237 461 aa22.62■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.62■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 TSPY2A6NKD2 308 aa22.61■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 F5H6K3 240 aa22.61■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 NMT2O60551 498 aa22.61■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 FLOT1O75955 427 aa22.61■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 TTLL1O95922 423 aa22.61■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 NDUFB10O96000 172 aa22.61■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 DSG3P32926 999 aa22.61■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 KLRC3Q07444 240 aa22.61■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.61■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.61■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.61■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.61■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.61■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 MYH8P13535 1937 aa22.61■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 NEFLP07196 543 aa22.6■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 ATG4CQ96DT6 458 aa22.6■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.6■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 GJD2Q9UKL4 321 aa22.6■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 RAD50Q92878 1312 aa22.59■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.59■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 NBPF11Q86T75 865 aa22.59■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.59■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 TOMM22Q9NS69 142 aa22.59■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 ZNF213O14771 459 aa22.58■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 MAPK4P31152 587 aa22.58■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 GRK4P32298 578 aa22.58■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 IRF5Q13568 498 aa22.58■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.58■■□□□ 1.21
EDC3-211ENST00000566243 BRCA2P51587 3418 aa22.58■■□□□ 1.2
EDC3-211ENST00000566243 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
EDC3-211ENST00000566243 ELNP15502 786 aa22.57■■□□□ 1.2
EDC3-211ENST00000566243 NOVP48745 357 aa22.57■■□□□ 1.2
EDC3-211ENST00000566243 RGS19P49795 217 aa22.57■■□□□ 1.2
EDC3-211ENST00000566243 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.57■■□□□ 1.2
EDC3-211ENST00000566243 GPR142Q7Z601 462 aa22.57■■□□□ 1.2
EDC3-211ENST00000566243 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.57■■□□□ 1.2
EDC3-211ENST00000566243 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.57■■□□□ 1.2
EDC3-211ENST00000566243 STX8Q9UNK0 236 aa22.57■■□□□ 1.2
EDC3-211ENST00000566243 NEDD4P46934 1319 aa22.57■■□□□ 1.2
EDC3-211ENST00000566243 SGSM2O43147 1006 aa22.56■■□□□ 1.2
EDC3-211ENST00000566243 ADCY3O60266 1144 aa22.56■■□□□ 1.2
EDC3-211ENST00000566243 CCNA1P78396 465 aa22.56■■□□□ 1.2
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