RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563645.1

GDE1-202, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 2

Gene GDE1, Length 769 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-202ENST00000563645 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.33□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 WASH4PA8MWX3 477 aa6.32□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 RACK1P63244 317 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 CREG2Q8IUH2 290 aa6.32□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 FAM168AQ92567 244 aa6.32□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 VWCEQ96DN2 955 aa6.32□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 ATG4CQ96DT6 458 aa6.32□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 CCDC120Q96HB5 630 aa6.32□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.32□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 ZNRF3Q9ULT6 936 aa6.32□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa6.32□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 UNCXA6NJT0 531 aa6.31□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.31□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 ANTXR1Q9H6X2 564 aa6.31□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.31□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.31□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 DUSP13Q9UII6 198 aa6.31□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 TNFRSF10CO14798 259 aa6.3□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 IMPDH2P12268 514 aa6.3□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 GDNFP39905 211 aa6.3□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 CCNFP41002 786 aa6.3□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.3□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 ZNF654Q8IZM8 581 aa6.3□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 SHISA3A0PJX4 238 aa6.29□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 LTKP29376 864 aa6.29□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 AFMP43652 599 aa6.29□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 EGR3Q06889 387 aa6.29□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.29□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.29□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.29□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.29□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa6.28□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 CLEC3AO75596 197 aa6.28□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 PAK2Q13177 524 aa6.28□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 KCNMB1Q16558 191 aa6.28□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.28□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 RALGPS1Q5JS13 557 aa6.28□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 OGFOD2Q6N063 350 aa6.28□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.28□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
GDE1-202ENST00000563645 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.27□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 NBPF9Q3BBW0 867 aa6.27□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 TTC6Q86TZ1 520 aa6.27□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.27□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 KIRREL1Q96J84 757 aa6.27□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 HDAC8Q9BY41 377 aa6.27□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 RAC2P15153 192 aa6.26□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 FYB2Q5VWT5 728 aa6.26□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 TMEM192Q8IY95 271 aa6.26□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 POU5F2Q8N7G0 328 aa6.26□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 SPATA32Q96LK8 384 aa6.26□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 SLC6A18Q96N87 628 aa6.26□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 SLC9A7Q96T83 725 aa6.26□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.26□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 PPT2Q9UMR5 302 aa6.26□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 GLI1P08151 1106 aa6.25□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 ACRP10323 421 aa6.25□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 HK2P52789 917 aa6.25□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 TEKQ02763 1124 aa6.25□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 TMC3Q7Z5M5 1100 aa6.25□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 GPRASP2Q96D09 838 aa6.25□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 TM9SF2Q99805 663 aa6.25□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.25□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 GINM1Q9NU53 330 aa6.25□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.24□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 HPXP02790 462 aa6.24□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 ZGLP1P0C6A0 271 aa6.24□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 SOX9P48436 509 aa6.24□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 C9orf131Q5VYM1 1079 aa6.24□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.24□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 DAGLBQ8NCG7 672 aa6.24□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 RASGRP4Q8TDF6 673 aa6.24□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.24□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
GDE1-202ENST00000563645 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.23□□□□□ -1.41
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