RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563386.5

USP10-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 4

Gene USP10, Length 590 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-208ENST00000563386 MGAMO43451 1857 aa22.49■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 HIP1O00291 1037 aa22.48■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 FGAP02671 866 aa22.48■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 TSPY3P0CV98 308 aa22.48■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 TSPY8P0CW00 308 aa22.48■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.48■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.48■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 COA7Q96BR5 231 aa22.48■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 VCPKMTQ9H867 229 aa22.48■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.48■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 GABRQQ9UN88 632 aa22.48■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 ALX1Q15699 326 aa22.47■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 NBPF11Q86T75 865 aa22.47■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 TOMM22Q9NS69 142 aa22.47■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 TFAP4Q01664 338 aa22.46■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 LPAR1Q92633 364 aa22.46■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 GOPCQ9HD26 462 aa22.46■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.46■■□□□ 1.19
USP10-208ENST00000563386 FLT3LGP49771 235 aa22.45■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 HAND2P61296 217 aa22.45■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 ERVK-9P63128 1117 aa22.45■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 ERVK-24P63145 666 aa22.45■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.45■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 FLOT1O75955 427 aa22.44■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 NEFLP07196 543 aa22.44■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 COG2Q14746 738 aa22.44■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 Q3C1V9 767 aa22.44■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 ARMC5Q96C12 935 aa22.44■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 CEP95Q96GE4 821 aa22.44■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 NYAP2Q9P242 653 aa22.44■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.44■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.44■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 TSPY2A6NKD2 308 aa22.43■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 GRK4P32298 578 aa22.43■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.43■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.43■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.43■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.184e-7■□□□□ 11.2
USP10-208ENST00000563386 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.43■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.42■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 ADCY3O60266 1144 aa22.42■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 CNMDO75829 334 aa22.42■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.42■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 WDR78Q5VTH9 848 aa22.42■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 SKAP1Q86WV1 359 aa22.42■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 ZNF333Q96JL9 665 aa22.42■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 PORCNQ9H237 461 aa22.42■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 BTBD7Q9P203 1132 aa22.42■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 TTLL1O95922 423 aa22.41■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 ELNP15502 786 aa22.41■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 MAPK4P31152 587 aa22.41■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.41■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.41■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.41■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 ZMYM6O95789 1325 aa22.4■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 F5H6K3 240 aa22.4■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 DSG3P32926 999 aa22.4■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 CCNA1P78396 465 aa22.4■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 KLRC3Q07444 240 aa22.4■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 PLS1Q14651 629 aa22.4■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 ATG4CQ96DT6 458 aa22.4■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.4■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
USP10-208ENST00000563386 HTTP42858 3142 aa22.39■■□□□ 1.17
USP10-208ENST00000563386 ORC4O43929 436 aa22.39■■□□□ 1.17
USP10-208ENST00000563386 NMT2O60551 498 aa22.39■■□□□ 1.17
USP10-208ENST00000563386 CHMLP26374 656 aa22.39■■□□□ 1.17
USP10-208ENST00000563386 LBX2Q6XYB7 198 aa22.39■■□□□ 1.17
USP10-208ENST00000563386 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.39■■□□□ 1.17
USP10-208ENST00000563386 MYH4Q9Y623 1939 aa22.39■■□□□ 1.17
USP10-208ENST00000563386 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.38■■□□□ 1.17
USP10-208ENST00000563386 POTEFA5A3E0 1075 aa22.38■■□□□ 1.17
USP10-208ENST00000563386 ZNF213O14771 459 aa22.38■■□□□ 1.17
USP10-208ENST00000563386 NDUFB10O96000 172 aa22.38■■□□□ 1.17
USP10-208ENST00000563386 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.38■■□□□ 1.17
USP10-208ENST00000563386 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.38■■□□□ 1.17
USP10-208ENST00000563386 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.38■■□□□ 1.17
USP10-208ENST00000563386 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.38■■□□□ 1.17
USP10-208ENST00000563386 NBPF3Q9H094 633 aa22.38■■□□□ 1.17
USP10-208ENST00000563386 IL25Q9H293 177 aa22.38■■□□□ 1.17
USP10-208ENST00000563386 GJD2Q9UKL4 321 aa22.38■■□□□ 1.17
USP10-208ENST00000563386 STX8Q9UNK0 236 aa22.38■■□□□ 1.17
USP10-208ENST00000563386 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.37■■□□□ 1.17
USP10-208ENST00000563386 CYP2B6P20813 491 aa22.37■■□□□ 1.17
USP10-208ENST00000563386 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
USP10-208ENST00000563386 MTFR1Q15390 333 aa22.37■■□□□ 1.17
USP10-208ENST00000563386 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms