RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561256.5

USP3-AS1-210, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-210ENST00000561256 MCM9Q9NXL9 1143 aa20.95■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa20.95■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 A0A1W2PRG0 241 aa20.94■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 POTEB2H3BUK9 544 aa20.94■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 RLBP1P12271 317 aa20.94■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 OLFML2BQ68BL8 750 aa20.94■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 CEP85Q6P2H3 762 aa20.94■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 SPATC1LQ9H0A9 340 aa20.94■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF236Q9UL36 1845 aa20.93■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 KBTBD13C9JR72 458 aa20.93■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 IGHA2P01877 340 aa20.93■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 ERCC3P19447 782 aa20.93■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa20.93■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 ANO1Q5XXA6 986 aa20.93■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.93■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM161BQ96MY7 647 aa20.93■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 GUCD1Q96NT3 240 aa20.93■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.93■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 PDE6AP16499 860 aa20.92■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 EVX2Q03828 476 aa20.92■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF697Q5TEC3 545 aa20.92■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.92■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 SEPT4O43236 478 aa20.91■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 PLS1Q14651 629 aa20.91■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.91■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM179Q6ZVK1 233 aa20.91■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP20.91■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 MB21D1Q8N884 522 aa20.91■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 SDR42E1Q8WUS8 393 aa20.91■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 LTBP2Q14767 1821 aa20.9■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 A0A0G2JMZ2 1700 aa20.9■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.9■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 COBLO75128 1261 aa20.9■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.9■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.9■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC44A5Q8NCS7 719 aa20.9■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 MROH8Q9H579 483 aa20.9■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 RLFQ13129 1914 aa20.9■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 A0A0C4DFX4 3053 aa20.89■□□□□ 0.94
USP3-AS1-210ENST00000561256 FLOT1O75955 427 aa20.89■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 CYP2D6P10635 497 aa20.89■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 DSG3P32926 999 aa20.89■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRIM60Q495X7 471 aa20.89■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 LCORLQ8N3X6 602 aa20.89■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.89■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.89■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 SWAP70Q9UH65 585 aa20.89■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 GOLIM4O00461 696 aa20.88■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 SHHQ15465 462 aa20.88■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.88■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa20.88■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 ABRAQ8N0Z2 381 aa20.88■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 SPICE1Q8N0Z3 855 aa20.88■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 ATG4CQ96DT6 458 aa20.88■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 SH2D4AQ9H788 454 aa20.88■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 CUL9Q8IWT3 2517 aa20.88■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 ADCYAP1R1P41586 468 aa20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 ICA1Q05084 483 aa20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 SNX17Q15036 470 aa20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 DYNLL2Q96FJ2 89 aa20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 MAML3Q96JK9 1138 aa20.87■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa20.86■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 MS4A1P11836 297 aa20.86■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 FCER1AP12319 257 aa20.86■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 AKR1B1P15121 316 aa20.86■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 LRRC41Q15345 812 aa20.86■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 C9orf50Q5SZB4 431 aa20.86■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 BADQ92934 168 aa20.86■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 FERMT2Q96AC1 680 aa20.86■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 BCL11AQ9H165 835 aa20.86■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 VCPKMTQ9H867 229 aa20.86■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 ARMT1Q9H993 441 aa20.86■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMX2Q9Y320 296 aa20.86■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 MYH8P13535 1937 aa20.86■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 APBB1O00213 710 aa20.85■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 WDR46O15213 610 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM47AQ5JRC9 791 aa20.85■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 PDLIM7Q9NR12 457 aa20.85■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 DNAH12Q6ZR08 3092 aa20.85■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC25A27O95847 323 aa20.84■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.84■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.84■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.84■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRKAB2O43741 272 aa20.83■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 MBD4O95243 580 aa20.83■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 RARBP10826 455 aa20.83■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.83■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 C1orf53Q5VUE5 145 aa20.83■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa20.83■□□□□ 0.93
USP3-AS1-210ENST00000561256 PANK1Q8TE04 598 aa20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms