RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560185.1

AKAP13-215, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 2

Gene AKAP13, Length 611 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-215	ENST00000560185	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	TRDN	Q13061	729 aa		18.83	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	COG2	Q14746	738 aa		18.83	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		18.83	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		18.83	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		18.83	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	CEP95	Q96GE4	821 aa		18.83	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	STX8	Q9UNK0	236 aa		18.83	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	18.83	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		18.82	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	FCGRT	P55899	365 aa		18.82	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	HERVK_113	P62684	666 aa		18.82	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		18.82	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	MKL1	Q969V6	931 aa		18.82	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	KRT23	Q9C075	422 aa		18.82	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		18.82	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		18.82	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	MYH7	P12883	1935 aa		18.82	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185		F5H6K3	240 aa		18.81	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	BCR	P11274	1271 aa		18.81	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	PSMC4	P43686	418 aa		18.81	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	KLRC3	Q07444	240 aa		18.81	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		18.81	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	IQCA1	Q86XH1	822 aa		18.81	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		18.81	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		18.81	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	IL25	Q9H293	177 aa		18.81	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		18.81	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	DOCK1	Q14185	1865 aa		18.81	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		18.8	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	FLOT1	O75955	427 aa		18.8	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		18.8	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	MAP4K1	Q92918	833 aa		18.8	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		18.8	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	SIPA1L1	O43166	1804 aa		18.79	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	CCNA1	P78396	465 aa		18.79	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	PTH1R	Q03431	593 aa		18.79	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		18.79	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	COA7	Q96BR5	231 aa		18.79	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	TTC14	Q96N46	770 aa		18.79	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		18.79	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		18.79	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		18.78	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	PRMT2	P55345	433 aa		18.78	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	SLFN13	Q68D06	897 aa		18.78	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		18.78	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		18.78	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		18.78	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		18.78	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	KDM4A	O75164	1064 aa		18.77	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		18.77	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	RNF20	Q5VTR2	975 aa		18.77	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	MB21D1	Q8N884	522 aa		18.77	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		18.77	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		18.77	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		18.77	■□□□□ 0.6
AKAP13-215	ENST00000560185	NMT2	O60551	498 aa		18.76	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	NDUFB10	O96000	172 aa		18.76	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	SLC1A4	P43007	532 aa		18.76	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		18.76	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		18.76	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	NBPF3	Q9H094	633 aa		18.76	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		18.76	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		18.76	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		18.76	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185		B4E1Z4	1266 aa		18.75	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	CYP21A2	P08686	494 aa		18.75	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	BMP3	P12645	472 aa		18.75	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	MAPK4	P31152	587 aa		18.75	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	DSG3	P32926	999 aa		18.75	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	ERVK-9	P63128	1117 aa		18.75	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	ERVK-24	P63145	666 aa		18.75	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	LBX2	Q6XYB7	198 aa		18.75	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	NBPF11	Q86T75	865 aa		18.75	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	DGKH	Q86XP1	1220 aa		18.75	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	NCOA7	Q8NI08	942 aa		18.75	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	RAET1E	Q8TD07	263 aa		18.75	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	TRIM47	Q96LD4	638 aa		18.75	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		18.75	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	FEM1B	Q9UK73	627 aa		18.75	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	MTMR7	Q9Y216	660 aa		18.75	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	NEDD4	P46934	1319 aa		18.74	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	MYPN	Q86TC9	1320 aa		18.74	■□□□□ 0.59
AKAP13-215	ENST00000560185	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59

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