RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560067.1

USP3-AS1-205, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 366 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-205ENST00000560067 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 ARMC5Q96C12 935 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 PAGR1Q9BTK6 254 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 GOPCQ9HD26 462 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 RBPJLQ9UBG7 517 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 SOX10P56693 466 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 TFAP4Q01664 338 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 COG2Q14746 738 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 TXNRD2Q9NNW7 524 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 NYAP2Q9P242 653 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 CLIP2Q9UDT6 1046 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 ANAPC4Q9UJX5 808 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 PTPRFP10586 1907 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 LOC285556D6RIA3 1793 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 WDR46O15213 610 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 PEX10O60683 326 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 NEFLP07196 543 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 FLT3LGP49771 235 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 ERVK-9P63128 1117 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 ERVK-24P63145 666 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 CCNA1P78396 465 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 GABRQQ9UN88 632 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 TSPY2A6NKD2 308 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 FLOT1O75955 427 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 TTLL1O95922 423 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 MAPK4P31152 587 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 GRK4P32298 578 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 Q3C1V9 767 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 LBX2Q6XYB7 198 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 SH3TC2Q8TF17 1288 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 RUFY2Q8WXA3 655 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 CEP95Q96GE4 821 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF333Q96JL9 665 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 INCENPQ9NQS7 918 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 TOMM22Q9NS69 142 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZMYM6O95789 1325 aa14.68□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 F5H6K3 240 aa14.68□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 HAND2P61296 217 aa14.68□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 KLRC3Q07444 240 aa14.68□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 IRF5Q13568 498 aa14.68□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 POTEEQ6S8J3 1075 aa14.68□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLAIN1Q8ND83 568 aa14.68□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa14.68□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF213O14771 459 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 ORC4O43929 436 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 ADCY3O60266 1144 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 CNMDO75829 334 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 MYCP01106 439 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 DSG3P32926 999 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 RGS19P49795 217 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 MFSD6Q6ZSS7 791 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 MB21D1Q8N884 522 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 MKL1Q969V6 931 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 CCDC136Q96JN2 1154 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 DSCC1Q9BVC3 393 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 BTBD7Q9P203 1132 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 CTNNA3Q9UI47 895 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 PLIN4Q96Q06 1357 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 NDUFB10O96000 172 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 FGRP09769 529 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 PCP11498 1178 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 CHMLP26374 656 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 UBXN2AP68543 259 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 AKNAD1Q5T1N1 836 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 WDR78Q5VTH9 848 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 PLEKHH3Q7Z736 793 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 PXYLP1Q8TE99 480 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 SOCS4Q8WXH5 440 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 NUDT12Q9BQG2 462 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 PORCNQ9H237 461 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 GJD2Q9UKL4 321 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 RAD50Q92878 1312 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 GPR142Q7Z601 462 aa14.65□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa14.65□□□□□ -0.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 STAG1Q8WVM7 1258 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms