RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552897.5

TPCN1-222, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 4

Gene TPCN1, Length 596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-222	ENST00000552897	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		28.68	■■■□□ 2.18
TPCN1-222	ENST00000552897	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		28.68	■■■□□ 2.18
TPCN1-222	ENST00000552897	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		28.68	■■■□□ 2.18
TPCN1-222	ENST00000552897	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		28.68	■■■□□ 2.18
TPCN1-222	ENST00000552897	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		28.67	■■■□□ 2.18
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF213	O14771	459 aa		28.67	■■■□□ 2.18
TPCN1-222	ENST00000552897	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
TPCN1-222	ENST00000552897	NMT2	O60551	498 aa		28.67	■■■□□ 2.18
TPCN1-222	ENST00000552897	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
TPCN1-222	ENST00000552897	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		28.67	■■■□□ 2.18
TPCN1-222	ENST00000552897	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		28.67	■■■□□ 2.18
TPCN1-222	ENST00000552897	TRIM17	Q9Y577	477 aa		28.67	■■■□□ 2.18
TPCN1-222	ENST00000552897	HERVK_113	P62684	666 aa		28.66	■■■□□ 2.18
TPCN1-222	ENST00000552897	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		28.66	■■■□□ 2.18
TPCN1-222	ENST00000552897	SH2D4A	Q9H788	454 aa		28.66	■■■□□ 2.18
TPCN1-222	ENST00000552897	TOMM22	Q9NS69	142 aa		28.66	■■■□□ 2.18
TPCN1-222	ENST00000552897	NEDD4	P46934	1319 aa		28.66	■■■□□ 2.18
TPCN1-222	ENST00000552897	TSPY2	A6NKD2	308 aa		28.65	■■■□□ 2.18
TPCN1-222	ENST00000552897	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		28.65	■■■□□ 2.18
TPCN1-222	ENST00000552897	MKL1	Q969V6	931 aa		28.65	■■■□□ 2.18
TPCN1-222	ENST00000552897	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		28.65	■■■□□ 2.18
TPCN1-222	ENST00000552897	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		28.65	■■■□□ 2.18
TPCN1-222	ENST00000552897	LPAR1	Q92633	364 aa		28.64	■■■□□ 2.18
TPCN1-222	ENST00000552897	EFCC1	Q9HA90	598 aa		28.64	■■■□□ 2.18
TPCN1-222	ENST00000552897	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		28.64	■■■□□ 2.18
TPCN1-222	ENST00000552897	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	TRIM47	Q96LD4	638 aa		28.63	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897		F5H6K3	240 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	TTLL1	O95922	423 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	PSMC4	P43686	418 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	KLRC3	Q07444	240 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	MAP4K1	Q92918	833 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	LAMA4	Q16363	1823 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	CNMD	O75829	334 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	NDUFB10	O96000	172 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	NOV	P48745	357 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897		Q3C1V9	767 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	GOPC	Q9HD26	462 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	RAD21	O60216	631 aa		28.6	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	CYP21A2	P08686	494 aa		28.6	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	KIF22	Q14807	665 aa		28.6	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	CDC45	O75419	566 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	ABHD8	Q96I13	439 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	RLF	Q13129	1914 aa		28.59	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897		B4E1Z4	1266 aa		28.58	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	COG2	Q14746	738 aa		28.58	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		28.58	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		28.58	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	BTBD7	Q9P203	1132 aa		28.58	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	STX8	Q9UNK0	236 aa		28.58	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		28.58	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	MYH4	Q9Y623	1939 aa		28.58	■■■□□ 2.17
TPCN1-222	ENST00000552897	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	LBX2	Q6XYB7	198 aa		28.57	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	KDM4A	O75164	1064 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	FLOT1	O75955	427 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	DSG3	P32926	999 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	ESR2	Q92731	530 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	FCGRT	P55899	365 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	ERVK-9	P63128	1117 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	ERVK-24	P63145	666 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	SLFN13	Q68D06	897 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	ATG4C	Q96DT6	458 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	ARHGEF6	Q15052	776 aa		28.54	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	28.54	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		28.54	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	PORCN	Q9H237	461 aa		28.54	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		28.54	■■■□□ 2.16

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