RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 MYCP01106 439 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 ERVK-9P63128 1117 aa24.9■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 ERVK-24P63145 666 aa24.9■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa24.9■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa24.9■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 PORCNQ9H237 461 aa24.9■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 VCPKMTQ9H867 229 aa24.9■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 DOCK3Q8IZD9 2030 aa24.9■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 SDSP20132 328 aa24.89■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 GRK4P32298 578 aa24.89■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 ATP2B2Q01814 1243 aa24.89■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 LBX2Q6XYB7 198 aa24.89■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 NBPF11Q86T75 865 aa24.89■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 GJD2Q9UKL4 321 aa24.89■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 MTFR1Q15390 333 aa24.88■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 LPAR1Q92633 364 aa24.88■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 COA7Q96BR5 231 aa24.88■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 INCENPQ9NQS7 918 aa24.88■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 BTBD7Q9P203 1132 aa24.88■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa24.88■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 ELNP15502 786 aa24.87■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.87■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 IRF5Q13568 498 aa24.87■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 ALX1Q15699 326 aa24.87■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 TANGO6Q9C0B7 1094 aa24.87■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 SH2D4AQ9H788 454 aa24.87■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 ADCY3O60266 1144 aa24.86■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 CCDC171Q6TFL3 1326 aa24.86■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 PLIN4Q96Q06 1357 aa24.85■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 FGAP02671 866 aa24.85■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 EN2P19622 333 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 FAM47AQ5JRC9 791 aa24.85■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 SLAIN1Q8ND83 568 aa24.85■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 CEP95Q96GE4 821 aa24.85■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 NYAP2Q9P242 653 aa24.85■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 ANAPC4Q9UJX5 808 aa24.85■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 RLFQ13129 1914 aa24.84■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 WDR46O15213 610 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 COG2Q14746 738 aa24.84■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 TTC22Q5TAA0 569 aa24.84■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.84■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 PDE4BQ07343 736 aa24.83■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 NEDD1Q8NHV4 660 aa24.83■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 PXYLP1Q8TE99 480 aa24.83■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 FBXO28Q9NVF7 368 aa24.83■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 MTMR4Q9NYA4 1195 aa24.83■■□□□ 1.57
CS-222ENST00000550996 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa24.83■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 PLXNB2O15031 1838 aa24.82■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 FLOT1O75955 427 aa24.82■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 MAPK4P31152 587 aa24.82■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 DSG3P32926 999 aa24.82■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 GPR142Q7Z601 462 aa24.82■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 USP6NLQ92738 828 aa24.82■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 ATG4CQ96DT6 458 aa24.82■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.82■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 IL25Q9H293 177 aa24.82■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 GOPCQ9HD26 462 aa24.82■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 HOXC10Q9NYD6 342 aa24.82■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 CLIP2Q9UDT6 1046 aa24.82■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 INHAP05111 366 aa24.81■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 FGRP09769 529 aa24.81■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 TFAP4Q01664 338 aa24.81■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 FAM83BQ5T0W9 1011 aa24.81■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 NBPF3Q9H094 633 aa24.81■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.81■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 ZMYM6O95789 1325 aa24.81■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 NDUFB10O96000 172 aa24.8■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 TSPY3P0CV98 308 aa24.8■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 TSPY8P0CW00 308 aa24.8■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 CCL5P13501 91 aa24.8■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 MORN1Q5T089 497 aa24.8■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 PLEKHH3Q7Z736 793 aa24.8■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 MKL1Q969V6 931 aa24.8■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 UNC93B1Q9H1C4 597 aa24.8■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 A0A0G2JMZ2 1700 aa24.8■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 F5H6K3 240 aa24.79■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 RAD21O60216 631 aa24.79■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 HAND2P61296 217 aa24.79■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 KLRC3Q07444 240 aa24.79■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.79■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 SHISA4Q96DD7 197 aa24.79■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 IL17RBQ9NRM6 502 aa24.79■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 ORC4O43929 436 aa24.78■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 NMT2O60551 498 aa24.78■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 TTLL1O95922 423 aa24.78■■□□□ 1.56
CS-222ENST00000550996 CYP2B6P20813 491 aa24.78■■□□□ 1.56
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