RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545464.5

MACROD1-208, Transcript of MACRO domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MACROD1, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MACROD1-208ENST00000545464 A0A1W2PRG0 241 aa29.74■■■□□ 2.35
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MACROD1-208ENST00000545464 CYBAP13498 195 aa29.74■■■□□ 2.35
MACROD1-208ENST00000545464 PLS1Q14651 629 aa29.74■■■□□ 2.35
MACROD1-208ENST00000545464 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
MACROD1-208ENST00000545464 GUCD1Q96NT3 240 aa29.74■■■□□ 2.35
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MACROD1-208ENST00000545464 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa29.73■■■□□ 2.35
MACROD1-208ENST00000545464 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
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MACROD1-208ENST00000545464 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
MACROD1-208ENST00000545464 ERC1Q8IUD2 1116 aa29.72■■■□□ 2.35
MACROD1-208ENST00000545464 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP29.72■■■□□ 2.354e-6■■■■■ 32.4
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MACROD1-208ENST00000545464 CEP85Q6P2H3 762 aa29.71■■■□□ 2.35
MACROD1-208ENST00000545464 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa29.71■■■□□ 2.35
MACROD1-208ENST00000545464 COBLO75128 1261 aa29.7■■■□□ 2.35
MACROD1-208ENST00000545464 PDE6AP16499 860 aa29.7■■■□□ 2.35
MACROD1-208ENST00000545464 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa29.7■■■□□ 2.35
MACROD1-208ENST00000545464 NCAPG2Q86XI2 1143 aa29.7■■■□□ 2.35
MACROD1-208ENST00000545464 SDR42E1Q8WUS8 393 aa29.7■■■□□ 2.35
MACROD1-208ENST00000545464 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
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MACROD1-208ENST00000545464 SLC44A5Q8NCS7 719 aa29.69■■■□□ 2.34
MACROD1-208ENST00000545464 ZNF532Q9HCE3 1301 aa29.69■■■□□ 2.34
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MACROD1-208ENST00000545464 SEPT4O43236 478 aa29.68■■■□□ 2.34
MACROD1-208ENST00000545464 FLOT1O75955 427 aa29.68■■■□□ 2.34
MACROD1-208ENST00000545464 IGHA2P01877 340 aa29.68■■■□□ 2.34
MACROD1-208ENST00000545464 SHHQ15465 462 aa29.68■■■□□ 2.34
MACROD1-208ENST00000545464 TRIM60Q495X7 471 aa29.68■■■□□ 2.34
MACROD1-208ENST00000545464 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa29.68■■■□□ 2.34
MACROD1-208ENST00000545464 SHCBP1Q8NEM2 672 aa29.68■■■□□ 2.34
MACROD1-208ENST00000545464 FERMT2Q96AC1 680 aa29.68■■■□□ 2.34
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MACROD1-208ENST00000545464 TMEM179Q6ZVK1 233 aa29.67■■■□□ 2.34
MACROD1-208ENST00000545464 BADQ92934 168 aa29.67■■■□□ 2.34
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MACROD1-208ENST00000545464 C9orf50Q5SZB4 431 aa29.66■■■□□ 2.34
MACROD1-208ENST00000545464 CLEC10AQ8IUN9 316 aa29.66■■■□□ 2.34
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MACROD1-208ENST00000545464 MB21D1Q8N884 522 aa29.66■■■□□ 2.34
MACROD1-208ENST00000545464 DYNLL2Q96FJ2 89 aa29.66■■■□□ 2.34
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MACROD1-208ENST00000545464 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa29.65■■■□□ 2.34
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MACROD1-208ENST00000545464 AKR1B1P15121 316 aa29.62■■■□□ 2.33
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MACROD1-208ENST00000545464 ZNF236Q9UL36 1845 aa29.61■■■□□ 2.33
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MACROD1-208ENST00000545464 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa29.6■■■□□ 2.33
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MACROD1-208ENST00000545464 RLFQ13129 1914 aa29.59■■■□□ 2.33
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MACROD1-208ENST00000545464 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
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MACROD1-208ENST00000545464 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa29.59■■■□□ 2.33
MACROD1-208ENST00000545464 MBD4O95243 580 aa29.58■■■□□ 2.33
MACROD1-208ENST00000545464 PGK2P07205 417 aa29.58■■■□□ 2.33
MACROD1-208ENST00000545464 TLE2Q04725 743 aa29.58■■■□□ 2.33
MACROD1-208ENST00000545464 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa29.57■■■□□ 2.32
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