RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	PFAS	O15067	1338 aa		19.37	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	ATP2B2	Q01814	1243 aa		19.37	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	HAUS7	Q99871	368 aa		19.37	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	GDF15	Q99988	308 aa		19.37	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	19.36	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	HOXC6	P09630	235 aa		19.36	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	SYN1	P17600	705 aa		19.36	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	BMP8B	P34820	402 aa		19.36	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	GRB14	Q14449	540 aa		19.36	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		19.36	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	COL6A1	P12109	1028 aa		19.35	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	AKR1B1	P15121	316 aa		19.35	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		19.35	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		19.35	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	19.35	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		19.35	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	19.34	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	MYH7	P12883	1935 aa		19.34	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		19.34	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	19.34	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	CHGB	P05060	677 aa		19.34	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	CNGA1	P29973	690 aa		19.34	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	CDK8	P49336	464 aa		19.34	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	UBE3C	Q15386	1083 aa		19.34	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	C12orf60	Q5U649	245 aa		19.34	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		19.34	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		19.34	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	CCDC17	Q96LX7	622 aa		19.34	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		19.34	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		19.34	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	TMX2	Q9Y320	296 aa		19.34	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	RLF	Q13129	1914 aa		19.33	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		19.33	■□□□□ 0.69
DDX11-222	ENST00000542777	USP17L12	C9JPN9	530 aa		19.33	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	USP17L21	D6R901	530 aa		19.33	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	SMIM22	K7EJ46	135 aa		19.33	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	STRN	O43815	780 aa		19.33	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	19.33	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	DSG3	P32926	999 aa		19.33	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	CYP2C19	P33261	490 aa		19.33	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	ICA1	Q05084	483 aa		19.33	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		19.33	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	DPP9	Q86TI2	863 aa		19.33	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		19.33	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	LPAR1	Q92633	364 aa		19.33	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		19.33	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	SH2D4A	Q9H788	454 aa		19.33	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		19.33	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	SZT2	Q5T011	3432 aa		19.32	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	ERCC3	P19447	782 aa		19.32	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	19.32	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		19.32	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		19.32	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		19.32	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	MB21D1	Q8N884	522 aa		19.32	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		19.32	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	LRCH3	Q96II8	777 aa		19.32	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	VCPKMT	Q9H867	229 aa		19.32	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	19.32	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	MSC	O60682	206 aa		19.31	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	FLOT1	O75955	427 aa		19.31	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	ADORA2A	P29274	412 aa		19.31	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	PLS1	Q14651	629 aa		19.31	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		19.31	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	ATG4C	Q96DT6	458 aa		19.31	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	19.31	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	IGHA2	P01877	340 aa		19.3	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	CTR9	Q6PD62	1173 aa		19.3	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	19.3	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	TRPV1	Q8NER1	839 aa		19.3	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	19.3	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777		A0A0G2JMZ2	1700 aa		19.3	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	19.29	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	COBL	O75128	1261 aa		19.29	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	CYBA	P13498	195 aa		19.29	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	19.29	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		19.29	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		19.29	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	MROH8	Q9H579	483 aa		19.29	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		19.29	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		19.29	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	19.28	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		19.28	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		19.28	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	TDH	Q8IZJ6	230 aa		19.27	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		19.27	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	19.27	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	PARP14	Q460N5	1801 aa		19.27	■□□□□ 0.68
DDX11-222	ENST00000542777	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	19.26	■□□□□ 0.67
DDX11-222	ENST00000542777	DNM1L	O00429	736 aa		19.26	■□□□□ 0.67
DDX11-222	ENST00000542777	SLC25A27	O95847	323 aa		19.26	■□□□□ 0.67
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		19.26	■□□□□ 0.67
DDX11-222	ENST00000542777	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	19.26	■□□□□ 0.67
DDX11-222	ENST00000542777	GOPC	Q9HD26	462 aa		19.26	■□□□□ 0.67
DDX11-222	ENST00000542777	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	19.25	■□□□□ 0.67
DDX11-222	ENST00000542777	RAD21	O60216	631 aa		19.25	■□□□□ 0.67
DDX11-222	ENST00000542777	FCER1A	P12319	257 aa		19.25	■□□□□ 0.67
DDX11-222	ENST00000542777	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	19.25	■□□□□ 0.67
DDX11-222	ENST00000542777	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	19.25	■□□□□ 0.67
DDX11-222	ENST00000542777	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		19.25	■□□□□ 0.67

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