RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542019.1

TM7SF3-210, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 737 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-210ENST00000542019 VCPKMTQ9H867 229 aa29.6■■■□□ 2.33
TM7SF3-210ENST00000542019 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa29.59■■■□□ 2.33
TM7SF3-210ENST00000542019 ALX1Q15699 326 aa29.59■■■□□ 2.33
TM7SF3-210ENST00000542019 ZNF333Q96JL9 665 aa29.59■■■□□ 2.33
TM7SF3-210ENST00000542019 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP29.59■■■□□ 2.33
TM7SF3-210ENST00000542019 FGAP02671 866 aa29.58■■■□□ 2.33
TM7SF3-210ENST00000542019 FLT3LGP49771 235 aa29.58■■■□□ 2.33
TM7SF3-210ENST00000542019 RGS19P49795 217 aa29.58■■■□□ 2.33
TM7SF3-210ENST00000542019 FAM47AQ5JRC9 791 aa29.58■■■□□ 2.33
TM7SF3-210ENST00000542019 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
TM7SF3-210ENST00000542019 RLFQ13129 1914 aa29.57■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 MYCP01106 439 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 ERVK-9P63128 1117 aa29.57■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 ERVK-24P63145 666 aa29.57■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa29.57■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 RAET1EQ8TD07 263 aa29.57■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 TANGO6Q9C0B7 1094 aa29.57■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 IL25Q9H293 177 aa29.57■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 SH2D4AQ9H788 454 aa29.57■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa29.57■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 PDE4BQ07343 736 aa29.56■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 SKAP1Q86WV1 359 aa29.56■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 LPAR1Q92633 364 aa29.56■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 PORCNQ9H237 461 aa29.56■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 ZNF287Q9HBT7 754 aa29.56■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 BTBD7Q9P203 1132 aa29.56■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 ANAPC4Q9UJX5 808 aa29.56■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 PLIN4Q96Q06 1357 aa29.55■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 POTEFA5A3E0 1075 aa29.55■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 CEP95Q96GE4 821 aa29.55■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 DOCK3Q8IZD9 2030 aa29.55■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 PLXNB2O15031 1838 aa29.55■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 TFAP4Q01664 338 aa29.54■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 LBX2Q6XYB7 198 aa29.54■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 COA7Q96BR5 231 aa29.54■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 NYAP2Q9P242 653 aa29.54■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 A0A0G2JMZ2 1700 aa29.54■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 PARP14Q460N5 1801 aa29.53■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 GRK4P32298 578 aa29.53■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 HAND2P61296 217 aa29.53■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 NEDD1Q8NHV4 660 aa29.53■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 NBPF3Q9H094 633 aa29.53■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 MTMR4Q9NYA4 1195 aa29.53■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 CLIP2Q9UDT6 1046 aa29.53■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa29.53■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 ZMYM6O95789 1325 aa29.52■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 WDR46O15213 610 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 RAD21O60216 631 aa29.52■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 TSPY3P0CV98 308 aa29.52■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 TSPY8P0CW00 308 aa29.52■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 COG2Q14746 738 aa29.52■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 NBPF11Q86T75 865 aa29.52■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 GJD2Q9UKL4 321 aa29.52■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 MYH4Q9Y623 1939 aa29.51■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 BRCA2P51587 3418 aa29.51■■■□□ 2.32
TM7SF3-210ENST00000542019 HIP1O00291 1037 aa29.51■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 ELNP15502 786 aa29.51■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 GOPCQ9HD26 462 aa29.51■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 FBXO28Q9NVF7 368 aa29.51■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 ADCY3O60266 1144 aa29.5■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 FLOT1O75955 427 aa29.5■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 IRF5Q13568 498 aa29.5■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 MTFR1Q15390 333 aa29.5■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 FAM83BQ5T0W9 1011 aa29.5■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 NKX2-3Q8TAU0 364 aa29.5■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 ATG4CQ96DT6 458 aa29.5■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 NMT2O60551 498 aa29.49■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 NDUFB10O96000 172 aa29.49■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 FGRP09769 529 aa29.49■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 DSG3P32926 999 aa29.49■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 TBC1D10CQ8IV04 446 aa29.49■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 IL17RBQ9NRM6 502 aa29.49■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 F5H6K3 240 aa29.48■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 KLRC3Q07444 240 aa29.48■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 GPR142Q7Z601 462 aa29.48■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 SLAIN1Q8ND83 568 aa29.48■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 TSPY2A6NKD2 308 aa29.47■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 ORC4O43929 436 aa29.47■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 TTLL1O95922 423 aa29.47■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 MAPK4P31152 587 aa29.47■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 MKL1Q969V6 931 aa29.47■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 HOXC10Q9NYD6 342 aa29.47■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 LAMA4Q16363 1823 aa29.46■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 TOMM22Q9NS69 142 aa29.46■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 EN2P19622 333 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 CHMLP26374 656 aa29.45■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 PXYLP1Q8TE99 480 aa29.45■■■□□ 2.31
TM7SF3-210ENST00000542019 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms