RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524304.1

HOXA-AS3-205, HOXA cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXA-AS3, Length 2,063 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS3-205ENST00000524304 ZNRF3Q9ULT6 936 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXA-AS3-205ENST00000524304 PTPAQ15257 358 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXA-AS3-205ENST00000524304 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXA-AS3-205ENST00000524304 MYH8P13535 1937 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXA-AS3-205ENST00000524304 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXA-AS3-205ENST00000524304 NIM1KQ8IY84 436 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXA-AS3-205ENST00000524304 SGIP1Q9BQI5 828 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXA-AS3-205ENST00000524304 LZTS2Q9BRK4 669 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXA-AS3-205ENST00000524304 FUCA2Q9BTY2 467 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXA-AS3-205ENST00000524304 PI4KBQ9UBF8 816 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXA-AS3-205ENST00000524304 MTMR7Q9Y216 660 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXA-AS3-205ENST00000524304 KRT2P35908 639 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CAMK4Q16566 473 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA-AS3-205ENST00000524304 SLC35G1Q2M3R5 365 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA-AS3-205ENST00000524304 RILPL1Q5EBL4 403 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA-AS3-205ENST00000524304 FSIP1Q8NA03 581 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA-AS3-205ENST00000524304 ENGASEQ8NFI3 743 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA-AS3-205ENST00000524304 PIBF1Q8WXW3 757 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA-AS3-205ENST00000524304 DNAJC18Q9H819 358 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA-AS3-205ENST00000524304 PPP6R2O75170 966 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA-AS3-205ENST00000524304 ENTPD3O75355 529 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA-AS3-205ENST00000524304 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
HOXA-AS3-205ENST00000524304 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
HOXA-AS3-205ENST00000524304 MAP3K11Q16584 847 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA-AS3-205ENST00000524304 TNMDQ9H2S6 317 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA-AS3-205ENST00000524304 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
HOXA-AS3-205ENST00000524304 SIPA1L1O43166 1804 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA-AS3-205ENST00000524304 KLRF2D3W0D1 207 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CYTH3O43739 400 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 SLURP2P0DP57 97 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 NPY5RQ15761 445 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CCDC17Q96LX7 622 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 HDAC9Q9UKV0 1011 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 GOLGA8HP0CJ92 632 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 FAM160A1Q05DH4 1040 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CD2APQ9Y5K6 639 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 SPDYE6P0CI01 402 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 JMYQ8N9B5 988 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CABP5Q9NP86 173 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 TTLL1O95922 423 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 OGFOD1Q8N543 542 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 AGBL3Q8NEM8 1001 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 TNFRSF25Q93038 417 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 SPZ1Q9BXG8 430 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 SH3GLB2Q9NR46 395 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 ATRNL1Q5VV63 1379 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 SMARCA1P28370 1054 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 NLRP5P59047 1200 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 A0A1B0GVL5 298 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 USP17L5A8MUK1 530 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CMA1P23946 247 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 EIF6P56537 245 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CXCL9Q07325 125 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 DLGAP5Q15398 846 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 TATDN1Q6P1N9 297 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 FAM196BA6NMK8 535 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 PDHBP11177 359 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CKAP2LQ8IYA6 745 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 RNF214Q8ND24 703 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 NFKBIEO00221 500 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 SNHG28P0DPA3 235 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 NDUFA8P51970 172 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 FAM205CA6NFA0 338 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 KINO60870 393 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CCDC192P0DO97 292 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA-AS3-205ENST00000524304 CALML3P27482 149 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms