RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521865.5

PABPC1-218, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, humanhuman

TSL 2

Gene PABPC1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1-218ENST00000521865 DDRGK1Q96HY6 314 aa25.14■■□□□ 1.62
PABPC1-218ENST00000521865 FLRT1Q9NZU1 646 aa25.14■■□□□ 1.62
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PABPC1-218ENST00000521865 GRB14Q14449 540 aa25.13■■□□□ 1.61
PABPC1-218ENST00000521865 GDF15Q99988 308 aa25.13■■□□□ 1.61
PABPC1-218ENST00000521865 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa25.13■■□□□ 1.61
PABPC1-218ENST00000521865 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa25.13■■□□□ 1.61
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PABPC1-218ENST00000521865 AKR1B1P15121 316 aa25.12■■□□□ 1.61
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PABPC1-218ENST00000521865 SH2D4AQ9H788 454 aa25.12■■□□□ 1.61
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PABPC1-218ENST00000521865 CLEC10AQ8IUN9 316 aa25.11■■□□□ 1.61
PABPC1-218ENST00000521865 SPICE1Q8N0Z3 855 aa25.11■■□□□ 1.61
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PABPC1-218ENST00000521865 SPATC1LQ9H0A9 340 aa25.1■■□□□ 1.61
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PABPC1-218ENST00000521865 USP17L12C9JPN9 530 aa25.09■■□□□ 1.61
PABPC1-218ENST00000521865 USP17L21D6R901 530 aa25.09■■□□□ 1.61
PABPC1-218ENST00000521865 MSCO60682 206 aa25.09■■□□□ 1.61
PABPC1-218ENST00000521865 ADORA2AP29274 412 aa25.09■■□□□ 1.61
PABPC1-218ENST00000521865 UBE3CQ15386 1083 aa25.09■■□□□ 1.61
PABPC1-218ENST00000521865 CCDC17Q96LX7 622 aa25.09■■□□□ 1.61
PABPC1-218ENST00000521865 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
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PABPC1-218ENST00000521865 CDK8P49336 464 aa25.08■■□□□ 1.61
PABPC1-218ENST00000521865 LRRC26Q2I0M4 334 aa25.08■■□□□ 1.61
PABPC1-218ENST00000521865 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa25.08■■□□□ 1.61
PABPC1-218ENST00000521865 C12orf60Q5U649 245 aa25.08■■□□□ 1.61
PABPC1-218ENST00000521865 MB21D1Q8N884 522 aa25.08■■□□□ 1.61
PABPC1-218ENST00000521865 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
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PABPC1-218ENST00000521865 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.06■■□□□ 1.6
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PABPC1-218ENST00000521865 C16orf86Q6ZW13 317 aa25.05■■□□□ 1.6
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PABPC1-218ENST00000521865 GOPCQ9HD26 462 aa25.02■■□□□ 1.6
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PABPC1-218ENST00000521865 KBTBD13C9JR72 458 aa24.99■■□□□ 1.59
PABPC1-218ENST00000521865 SLC25A27O95847 323 aa24.99■■□□□ 1.59
PABPC1-218ENST00000521865 TMEM132BQ14DG7 1078 aa24.99■■□□□ 1.59
PABPC1-218ENST00000521865 LRIT3Q3SXY7 679 aa24.99■■□□□ 1.59
PABPC1-218ENST00000521865 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
PABPC1-218ENST00000521865 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.99■■□□□ 1.59
PABPC1-218ENST00000521865 FBXO28Q9NVF7 368 aa24.99■■□□□ 1.59
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