RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517871.1

RRNAD1-208, Transcript of ribosomal RNA adenine dimethylase domain containing 1, human

TSL 3

Gene RRNAD1, Length 479 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRNAD1-208	ENST00000517871	NMT2	O60551	498 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	CTDNEP1	O95476	244 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	AKR1B1	P15121	316 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	INHBE	P58166	350 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	FGD1	P98174	961 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	TROAP	Q12815	778 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	VGLL4	Q14135	290 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	NTRK3	Q16288	839 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	WNK4	Q96J92	1243 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	DDAH1	O94760	285 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	TSPY3	P0CV98	308 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	TSPY8	P0CW00	308 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	TM4SF4	P48230	202 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	SREBF2	Q12772	1141 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	ERO1B	Q86YB8	467 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	ZIC5	Q96T25	663 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	MAP3K14	Q99558	947 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	ELP3	Q9H9T3	547 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	MYH4	Q9Y623	1939 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	ERICH2	A1L162	156 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	FAM196B	A6NMK8	535 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	ZBTB43	O43298	467 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	GUCY1A2	P33402	732 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	JAG1	P78504	1218 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	PPP2R5B	Q15173	497 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	OPTN	Q96CV9	577 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	CEP95	Q96GE4	821 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RRNAD1-208	ENST00000517871	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	CCDC69	A6NI79	296 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	CDC27	P30260	824 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	INPP5B	P32019	993 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	PPAT	Q06203	517 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	FUT2	Q10981	343 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	STK3	Q13188	491 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	SNHG28	P0DPA3	235 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	13.69	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	GTF2A2	P52657	109 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	PPIL2	Q13356	520 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	RGS22	Q8NE09	1264 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	MKL1	Q969V6	931 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	MYL10	Q9BUA6	226 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	PICK1	Q9NRD5	415 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	DOCK1	Q14185	1865 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	STK36	Q9NRP7	1315 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	JAK2	O60674	1132 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	ALDH1A1	P00352	501 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	CALM1	P0DP23	149 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	CALM2	P0DP24	149 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	CALM3	P0DP25	149 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	IFNAR1	P17181	557 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	GJB2	P29033	226 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	GJA5	P36382	358 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	GRM4	Q14833	912 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RRNAD1-208	ENST00000517871	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		13.68	□□□□□ -0.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms