RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516635.1

RNU6-344P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 344, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-344P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-344P-201ENST00000516635 ST14Q9Y5Y6 855 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 LTBP3Q9NS15 1303 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 SHISA3A0PJX4 238 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 C9IYK1 514 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 TNFRSF10CO14798 259 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 FGRP09769 529 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 CD8BP10966 210 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 ETFBP38117 255 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 GIPRP48546 466 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 EIF6P56537 245 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 AOC3Q16853 763 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 NAALADL2Q58DX5 795 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 UNC5AQ6ZN44 842 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 PPFIBP1Q86W92 1011 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 CPLX3Q8WVH0 158 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 ATP13A1Q9HD20 1204 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRDM7Q9NQW5 492 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZSWIM5Q9P217 1185 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 A0A1W2PQH9 124 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRNPP04156 253 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 TP53P04637 393 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 IMPDH2P12268 514 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 GUCY2CP25092 1073 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 ETV3P41162 512 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 PPP2R5EQ16537 467 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMC3Q7Z5M5 1100 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 TTC6Q86TZ1 520 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 DTWD2Q8NBA8 298 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 RNF141Q8WVD5 230 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 UBE2FQ969M7 185 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 SEC16BQ96JE7 1060 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPATA32Q96LK8 384 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 CRBNQ96SW2 442 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 TM9SF2Q99805 663 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF408Q9H9D4 720 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 MKNK2Q9HBH9 465 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 SEMA3GQ9NS98 782 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-344P-201ENST00000516635 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM265A0A087WTH1 108 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 CLEC3AO75596 197 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 CYP7A1P22680 504 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 ARID5AQ03989 594 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRKCQQ04759 706 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 DCAF15Q66K64 600 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 C22orf34Q6ZV56 151 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 FLCNQ8NFG4 579 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 HRASLS5Q96KN8 279 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 FBXL18Q96ME1 805 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC5A6Q9Y289 635 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 B2RBV5 119 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 MEIS1O00470 390 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 SHOXO15266 292 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 WNT11O96014 354 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 KIR3DL1P43629 444 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 CLCN7P51798 805 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 GP2P55259 537 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 CHMP4BP1P59074 171 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 IKZF1Q13422 519 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 NBPF9Q3BBW0 867 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 VSIG10LQ86VR7 867 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 VPS37DQ86XT2 251 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 TP53INP2Q8IXH6 220 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 ABI1Q8IZP0 508 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC43A3Q8NBI5 491 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 GMLQ99445 158 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 ASPNQ9BXN1 380 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRDM14Q9GZV8 571 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 VAV3Q9UKW4 847 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRAMEF1O95521 474 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 ESR1P03372 595 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 SRFP11831 508 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-344P-201ENST00000516635 CCNFP41002 786 aa3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.8 ms