RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	CSF1R	P07333	972 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	CAPN2	P17655	700 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	PBX1	P40424	430 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	RPIA	P49247	311 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	HAND2	P61296	217 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	MORC3	Q14149	939 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	APOA5	Q6Q788	366 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	HOMER1	Q86YM7	354 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	NCOA7	Q8NI08	942 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	SPATA20	Q8TB22	786 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	XAGE2	Q96GT9	111 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	CLIC6	Q96NY7	704 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	PANX2	Q96RD6	677 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	LY9	Q9HBG7	655 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	SENP2	Q9HC62	589 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	PAPPA	Q13219	1627 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A1B0GTH6	734 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ZBBX	A8MT70	800 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	MAP2K7	O14733	419 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	CPLX1	O14810	134 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	FOXN1	O15353	648 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	GPAA1	O43292	621 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	SERPINC1	P01008	464 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	CASQ1	P31415	396 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ADD2	P35612	726 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ZAP70	P43403	619 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	USP5	P45974	858 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	CABP4	P57796	275 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	PTK2	Q05397	1052 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	VAC14	Q08AM6	782 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TRIM32	Q13049	653 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	NR1I3	Q14994	352 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	BRD3	Q15059	726 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	CFAP100	Q494V2	611 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC01559	Q495D7	138 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC102B	Q68D86	513 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	OLFM4	Q6UX06	510 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	IQUB	Q8NA54	791 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	MLKL	Q8NB16	471 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	MNS1	Q8NEH6	495 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	FUT8	Q9BYC5	575 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ERICH4	A6NGS2	130 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746		H3BQF6	201 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF213	O14771	459 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ZBTB43	O43298	467 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	A1BG	P04217	495 aa		5.67	□□□□□ -1.5

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