RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-223ENST00000515011 BMP15O95972 392 aa26.22■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 GRIN1Q05586 938 aa26.22■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 KRBA2Q6ZNG9 492 aa26.22■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 STAG2Q8N3U4 1231 aa26.21■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 SH3GLB2Q9NR46 395 aa26.21■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 ATP2B1P20020 1258 aa26.2■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 CDC25BP30305 580 aa26.2■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 DOK7Q18PE1 504 aa26.2■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 SPC24Q8NBT2 197 aa26.2■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 STX8Q9UNK0 236 aa26.2■■□□□ 1.79
PDE4D-223ENST00000515011 NLRP5P59047 1200 aa26.2■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 LONRF3Q496Y0 759 aa26.2■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 AOPEPQ8N6M6 819 aa26.2■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.19■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 STYK1Q6J9G0 422 aa26.19■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.19■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.19■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 CALML3P27482 149 aa26.19■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 SPECC1Q5M775 1068 aa26.19■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 CNNM3Q8NE01 707 aa26.19■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 LZTS2Q9BRK4 669 aa26.19■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 PLIN4Q96Q06 1357 aa26.18■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 F8W031 263 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 NOVP48745 357 aa26.18■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 PIBF1Q8WXW3 757 aa26.18■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 BIN1O00499 593 aa26.17■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 TRAPPC10P48553 1259 aa26.17■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 TTC38Q5R3I4 469 aa26.17■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 OFD1O75665 1012 aa26.17■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 PNOCQ13519 176 aa26.17■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 SLC35G1Q2M3R5 365 aa26.17■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 CSRNP2Q9H175 543 aa26.17■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 GABPAQ06546 454 aa26.16■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 HHIPL2Q6UWX4 724 aa26.16■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 FERMT2Q96AC1 680 aa26.16■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa26.16■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 MXD3Q9BW11 206 aa26.16■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.16■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 G3V3G9 751 aa26.16■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 WNT7AO00755 349 aa26.16■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 DCAF8Q5TAQ9 597 aa26.16■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 PODNQ7Z5L7 613 aa26.16■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 H0YIN7 160 aa26.15■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 CYTH3O43739 400 aa26.15■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 TOP1P11387 765 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 PICALMQ13492 652 aa26.15■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 KCNF1Q9H3M0 494 aa26.15■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 CEP95Q96GE4 821 aa26.14■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 SPZ1Q9BXG8 430 aa26.14■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
PDE4D-223ENST00000515011 BLIDQ8IZY5 108 aa26.14■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP26.14■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 PCDHA4Q9UN74 947 aa26.14■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa26.13■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 DRC7Q8IY82 874 aa26.13■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 TEKT1Q969V4 418 aa26.13■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 USP40Q9NVE5 1235 aa26.13■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF174Q15697 407 aa26.13■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 DAGLBQ8NCG7 672 aa26.13■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC148Q8NFR7 591 aa26.13■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 CLIP2Q9UDT6 1046 aa26.13■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 SLX4Q8IY92 1834 aa26.12■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 ADAMTS3O15072 1205 aa26.12■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 SCNN1DP51172 638 aa26.12■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 SLC15A2Q16348 729 aa26.12■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 WWC2Q6AWC2 1192 aa26.12■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 SERTAD1Q9UHV2 236 aa26.12■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 MYO3BQ8WXR4 1341 aa26.12■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 KLRF2D3W0D1 207 aa26.12■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 PTGS1P23219 599 aa26.12■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 GALNT17Q6IS24 598 aa26.12■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 TYW1BQ6NUM6 668 aa26.12■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa26.12■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 DBNDD1Q9H9R9 158 aa26.12■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 BARHL2Q9NY43 387 aa26.12■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 MTMR7Q9Y216 660 aa26.12■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa26.12■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 SMTNL1A8MU46 457 aa26.11■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 IKBKBO14920 756 aa26.11■■□□□ 1.77
PDE4D-223ENST00000515011 SMARCA1P28370 1054 aa26.11■■□□□ 1.77
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