RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513533.1

HOXC-AS2-201, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS2, Length 504 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 V9GY48 417 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.13□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SBF1O95248 1867 aa14.12□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.12□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KLRF2D3W0D1 207 aa14.12□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRAK2O60296 914 aa14.12□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NOVP48745 357 aa14.12□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ICA1Q05084 483 aa14.12□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRAF1Q13077 416 aa14.12□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa14.12□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C9orf131Q5VYM1 1079 aa14.12□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa14.12□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCDC148Q8NFR7 591 aa14.12□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DCAF4Q8WV16 495 aa14.12□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GOPCQ9HD26 462 aa14.12□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SH3GLB2Q9NR46 395 aa14.12□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HACL1Q9UJ83 578 aa14.12□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MTMR7Q9Y216 660 aa14.12□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 hCG_1984214I3L0E3 225 aa14.11□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ASNSP08243 561 aa14.11□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GUCY1B3Q02153 619 aa14.11□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KRT40Q6A162 431 aa14.11□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GALNT17Q6IS24 598 aa14.11□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SAMD7Q7Z3H4 446 aa14.11□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NBPF11Q86T75 865 aa14.11□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MKL1Q969V6 931 aa14.11□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPATA32Q96LK8 384 aa14.11□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPZ1Q9BXG8 430 aa14.11□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.11□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RAD21O60216 631 aa14.1□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PPFIA3O75145 1194 aa14.1□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SCG2P13521 617 aa14.1□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NLRP5P59047 1200 aa14.1□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RESTQ13127 1097 aa14.1□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCDC96Q2M329 555 aa14.1□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DEFB129Q9H1M3 183 aa14.1□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MAD2L2Q9UI95 211 aa14.1□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa14.1□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CNTNAP1P78357 1384 aa14.09□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IQCA1LA6NCM1 817 aa14.09□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FIBPO43427 364 aa14.09□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PLEKHA8P1O95397 391 aa14.09□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GH2P01242 217 aa14.09□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MMP1P03956 469 aa14.09□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EEF2P13639 858 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP14.09□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KRT2P35908 639 aa14.09□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SLC1A4P43007 532 aa14.09□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 UBE2HP62256 183 aa14.09□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SEPT2Q15019 361 aa14.09□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 USP48Q86UV5 1035 aa14.09□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 JMYQ8N9B5 988 aa14.09□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMEM87AQ8NBN3 555 aa14.09□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF341Q9BYN7 854 aa14.09□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CEP131Q9UPN4 1083 aa14.09□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MYH4Q9Y623 1939 aa14.09□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ELP1O95163 1332 aa14.09□□□□□ -0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GDF11O95390 407 aa14.08□□□□□ -0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PDHBP11177 359 aa14.08□□□□□ -0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GNA11P29992 359 aa14.08□□□□□ -0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PRELPP51888 382 aa14.08□□□□□ -0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MAP3K10Q02779 954 aa14.08□□□□□ -0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KLHL40Q2TBA0 621 aa14.08□□□□□ -0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SLFN13Q68D06 897 aa14.08□□□□□ -0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SULF1Q8IWU6 871 aa14.08□□□□□ -0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa14.08□□□□□ -0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BICD2Q8TD16 824 aa14.08□□□□□ -0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP14.08□□□□□ -0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.08□□□□□ -0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DNAJC18Q9H819 358 aa14.08□□□□□ -0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CNPY2Q9Y2B0 182 aa14.08□□□□□ -0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.08□□□□□ -0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM196BA6NMK8 535 aa14.07□□□□□ -0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 USP17L5A8MUK1 530 aa14.07□□□□□ -0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DDNO94850 711 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NF2P35240 595 aa14.07□□□□□ -0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CAP2P40123 477 aa14.07□□□□□ -0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF543Q08ER8 600 aa14.07□□□□□ -0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 STK38Q15208 465 aa14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms