RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513333.1

EPB41L4A-208, Transcript of erythrocyte membrane protein band 4.1 like 4A, human

TSL 5

Gene EPB41L4A, Length 333 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ALX3	O95076	343 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	RAPGEF3	O95398	923 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	APP	P05067	770 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ITGAV	P06756	1048 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ITGA4	P13612	1032 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ELN	P15502	786 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	MASP1	P48740	699 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PPP2R2A	P63151	447 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	RNF4	P78317	190 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	RING1	Q06587	406 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	KCNMA1	Q12791	1236 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	GRIK4	Q16099	956 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	FAM209A	Q5JX71	171 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CDH24	Q86UP0	819 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	NIM1K	Q8IY84	436 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	MFSD3	Q96ES6	412 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	TRIM11	Q96F44	468 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CEP89	Q96ST8	783 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CEP41	Q9BYV8	373 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	AKT3	Q9Y243	479 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		2.55	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	MEGF11	A6BM72	1044 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	TM4SF5	O14894	197 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ADCY3	O60266	1144 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	LRIG2	O94898	1065 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	KCNH1	O95259	989 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	APBA3	O96018	575 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	NFIC	P08651	508 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	NTF4	P34130	210 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SOX5	P35711	763 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ETV3	P41162	512 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PREP	P48147	710 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	GSK3A	P49840	483 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	NSMF	Q6X4W1	530 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	UBR7	Q8N806	425 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	BVES	Q8NE79	360 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	NINJ1	Q92982	152 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	BRF1	Q92994	677 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SGSM3	Q96HU1	749 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	EXOC2	Q96KP1	924 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	IER2	Q9BTL4	223 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	TMX1	Q9H3N1	280 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	WHRN	Q9P202	907 aa		2.54	□□□□□ -2

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