RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 SLC12A7Q9Y666 1083 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRK-215ENST00000498284 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRK-215ENST00000498284 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 LRRN2O75325 713 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 MED26O95402 600 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 CEACAM5P06731 702 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 SSTR4P31391 388 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 MSMPQ1L6U9 139 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 Q96M66 194 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 LTBP3Q9NS15 1303 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 KCNH3Q9ULD8 1083 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM265A0A087WTH1 108 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 CD97P48960 835 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 TNK2Q07912 1038 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 CDKAL1Q5VV42 579 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 DTWD2Q8NBA8 298 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 ARMC5Q96C12 935 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
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PTPRK-215ENST00000498284 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 C9IYK1 514 aa6.93□□□□□ -1.3
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PTPRK-215ENST00000498284 BBS9Q3SYG4 887 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 PPFIBP1Q86W92 1011 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 DRC1Q96MC2 740 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
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PTPRK-215ENST00000498284 GNPTABQ3T906 1256 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 DTX1Q86Y01 620 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 CKAP2LQ8IYA6 745 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 HSPA12BQ96MM6 686 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 KLF4O43474 513 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 SPINK2P20155 84 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 RBL2Q08999 1139 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 AUHQ13825 339 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 FXNQ16595 210 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 AOC3Q16853 763 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 VHLLQ6RSH7 139 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 MISP3Q96FF7 219 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 VAV3Q9UKW4 847 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 H3BS24 57 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 PRNPP04156 253 aa6.9□□□□□ -1.3
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PTPRK-215ENST00000498284 KIAA1211LQ6NV74 962 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.9□□□□□ -1.3
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PTPRK-215ENST00000498284 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 FBXL21Q9UKT6 434 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-215ENST00000498284 SRFP11831 508 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-215ENST00000498284 BNIP3Q12983 259 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-215ENST00000498284 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-215ENST00000498284 RAB33AQ14088 237 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-215ENST00000498284 LRP8Q14114 963 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-215ENST00000498284 NCAPHQ15003 741 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-215ENST00000498284 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-215ENST00000498284 DCAF15Q66K64 600 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-215ENST00000498284 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-215ENST00000498284 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-215ENST00000498284 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-215ENST00000498284 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-215ENST00000498284 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-215ENST00000498284 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
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