RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493959.6

SENP6-211, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 867 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-211ENST00000493959 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
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SENP6-211ENST00000493959 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
SENP6-211ENST00000493959 RASA1P20936 1047 aa27.13■■□□□ 1.93
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SENP6-211ENST00000493959 GPR142Q7Z601 462 aa27.13■■□□□ 1.93
SENP6-211ENST00000493959 IFNL3Q8IZI9 196 aa27.13■■□□□ 1.93
SENP6-211ENST00000493959 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
SENP6-211ENST00000493959 NUDT12Q9BQG2 462 aa27.13■■□□□ 1.93
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SENP6-211ENST00000493959 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa27.13■■□□□ 1.93
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SENP6-211ENST00000493959 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa27.12■■□□□ 1.93
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SENP6-211ENST00000493959 TRIB2Q92519 343 aa27.12■■□□□ 1.93
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SENP6-211ENST00000493959 MORN1Q5T089 497 aa27.11■■□□□ 1.93
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SENP6-211ENST00000493959 VCPKMTQ9H867 229 aa27.11■■□□□ 1.93
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SENP6-211ENST00000493959 MKNK2Q9HBH9 465 aa27.11■■□□□ 1.93
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SENP6-211ENST00000493959 NKX2-3Q8TAU0 364 aa27.1■■□□□ 1.93
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SENP6-211ENST00000493959 CCL14Q16627 93 aa27.09■■□□□ 1.93
SENP6-211ENST00000493959 WDR78Q5VTH9 848 aa27.09■■□□□ 1.93
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SENP6-211ENST00000493959 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa27.09■■□□□ 1.93
SENP6-211ENST00000493959 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
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SENP6-211ENST00000493959 EVI5LQ96CN4 794 aa27.08■■□□□ 1.93
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SENP6-211ENST00000493959 CCNA1P78396 465 aa27.07■■□□□ 1.92
SENP6-211ENST00000493959 SOCS4Q8WXH5 440 aa27.07■■□□□ 1.92
SENP6-211ENST00000493959 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP27.07■■□□□ 1.92
SENP6-211ENST00000493959 SH2D4AQ9H788 454 aa27.07■■□□□ 1.92
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SENP6-211ENST00000493959 FBXO28Q9NVF7 368 aa27.07■■□□□ 1.92
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SENP6-211ENST00000493959 FLOT1O75955 427 aa27.06■■□□□ 1.92
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SENP6-211ENST00000493959 ATG4CQ96DT6 458 aa27.06■■□□□ 1.92
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SENP6-211ENST00000493959 RGS2P41220 211 aa27.04■■□□□ 1.92
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SENP6-211ENST00000493959 CHD1LQ86WJ1 897 aa27.04■■□□□ 1.92
SENP6-211ENST00000493959 FAM227BQ96M60 508 aa27.04■■□□□ 1.92
SENP6-211ENST00000493959 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
SENP6-211ENST00000493959 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa27.04■■□□□ 1.92
SENP6-211ENST00000493959 NAPBQ9H115 298 aa27.04■■□□□ 1.92
SENP6-211ENST00000493959 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
SENP6-211ENST00000493959 RPTORQ8N122 1335 aa27.04■■□□□ 1.92
SENP6-211ENST00000493959 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa27.03■■□□□ 1.92
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SENP6-211ENST00000493959 FAM83BQ5T0W9 1011 aa27.03■■□□□ 1.92
SENP6-211ENST00000493959 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa27.03■■□□□ 1.92
SENP6-211ENST00000493959 SPATC1LQ9H0A9 340 aa27.03■■□□□ 1.92
SENP6-211ENST00000493959 FLRT1Q9NZU1 646 aa27.03■■□□□ 1.92
SENP6-211ENST00000493959 CLIP2Q9UDT6 1046 aa27.03■■□□□ 1.92
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SENP6-211ENST00000493959 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
SENP6-211ENST00000493959 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
SENP6-211ENST00000493959 PPARAQ07869 468 aa27.02■■□□□ 1.92
SENP6-211ENST00000493959 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
SENP6-211ENST00000493959 PLS1Q14651 629 aa27.02■■□□□ 1.92
SENP6-211ENST00000493959 FAM47AQ5JRC9 791 aa27.02■■□□□ 1.92
SENP6-211ENST00000493959 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa27.02■■□□□ 1.92
SENP6-211ENST00000493959 GOPCQ9HD26 462 aa27.02■■□□□ 1.92
SENP6-211ENST00000493959 NYAP2Q9P242 653 aa27.02■■□□□ 1.92
SENP6-211ENST00000493959 TACC3Q9Y6A5 838 aa27.02■■□□□ 1.92
SENP6-211ENST00000493959 ERCC3P19447 782 aa27.01■■□□□ 1.91
SENP6-211ENST00000493959 CTDSPL2Q05D32 466 aa27.01■■□□□ 1.91
SENP6-211ENST00000493959 NPLOC4Q8TAT6 608 aa27.01■■□□□ 1.91
SENP6-211ENST00000493959 A0A0D9SFI3 127 aa27■■□□□ 1.91
SENP6-211ENST00000493959 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa27■■□□□ 1.91
SENP6-211ENST00000493959 F5H6K3 240 aa27■■□□□ 1.91
SENP6-211ENST00000493959 KLRC3Q07444 240 aa27■■□□□ 1.91
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