RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 MKNK2Q9HBH9 465 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDSP1-211ENST00000492545 DOCK3Q8IZD9 2030 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDSP1-211ENST00000492545 MINDY4BA8MYZ0 360 aa28.28■■■□□ 2.12
CTDSP1-211ENST00000492545 SMIM22K7EJ46 135 aa28.28■■■□□ 2.12
CTDSP1-211ENST00000492545 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
CTDSP1-211ENST00000492545 ROBO3Q96MS0 1386 aa28.27■■■□□ 2.12
CTDSP1-211ENST00000492545 HMGCRP04035 888 aa28.27■■■□□ 2.12
CTDSP1-211ENST00000492545 PLEKHH3Q7Z736 793 aa28.27■■■□□ 2.12
CTDSP1-211ENST00000492545 IFNL3Q8IZI9 196 aa28.27■■■□□ 2.12
CTDSP1-211ENST00000492545 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 CNMDO75829 334 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 EEF2P13639 858 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 GPR142Q7Z601 462 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 MB21D1Q8N884 522 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 TANGO6Q9C0B7 1094 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 UNC93B1Q9H1C4 597 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 PORCNQ9H237 461 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 WDR46O15213 610 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 PEX10O60683 326 aa28.25■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 EXOC6Q8TAG9 804 aa28.25■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 GOPCQ9HD26 462 aa28.25■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 SGPL1O95470 568 aa28.24■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 RASA1P20936 1047 aa28.24■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 USP6NLQ92738 828 aa28.24■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 LNPKQ9C0E8 428 aa28.24■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 CYP2B6P20813 491 aa28.23■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 RGS2P41220 211 aa28.23■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 MORN1Q5T089 497 aa28.23■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP28.23■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 NAPBQ9H115 298 aa28.23■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 BTBD7Q9P203 1132 aa28.23■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 MYH8P13535 1937 aa28.22■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 ATP2B2Q01814 1243 aa28.22■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 PDE4BQ07343 736 aa28.22■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa28.22■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 CHD1LQ86WJ1 897 aa28.22■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 CLEC10AQ8IUN9 316 aa28.22■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 SHISA4Q96DD7 197 aa28.22■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 HELLSQ9NRZ9 838 aa28.22■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 NYAP2Q9P242 653 aa28.22■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 RPTORQ8N122 1335 aa28.21■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 DSG3P32926 999 aa28.21■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 NUCB1Q02818 461 aa28.21■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 SPICE1Q8N0Z3 855 aa28.21■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa28.21■■■□□ 2.11
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC15A5A6NIM6 579 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 FLOT1O75955 427 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 IGHDP01880 384 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 STRNO43815 780 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 PTPREP23469 700 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 MAP2K5Q13163 448 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 SHCBP1Q8NEM2 672 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 TRIB2Q92519 343 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 DEFB118Q96PH6 123 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 APBA2Q99767 749 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 OSBPL3Q9H4L5 887 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 TFRCP02786 760 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 PPARAQ07869 468 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 WDR78Q5VTH9 848 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 SPATC1LQ9H0A9 340 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP28.18■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa28.17■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 STK11IPQ8N1F8 1099 aa28.17■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 MROH8Q9H579 483 aa28.17■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa28.17■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 HOXC6P09630 235 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 GRB14Q14449 540 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 ALX1Q15699 326 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 MKL1Q969V6 931 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa28.15■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 NEDD1Q8NHV4 660 aa28.15■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 MTMR4Q9NYA4 1195 aa28.15■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 F5H6K3 240 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 PRDM1O75626 825 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 TSPY3P0CV98 308 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 TSPY8P0CW00 308 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 KLRC3Q07444 240 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 ANKLE1Q8NAG6 615 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDSP1-211ENST00000492545 ATG4CQ96DT6 458 aa28.14■■■□□ 2.1
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