RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489650.1

PTPRN-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-217ENST00000489650 MTMR10Q9NXD2 777 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 GOLIM4O00461 696 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 COG2Q14746 738 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 LCORLQ8N3X6 602 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 ADORA2AP29274 412 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 ARMT1Q9H993 441 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 RLFQ13129 1914 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 CYBAP13498 195 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 PLS1Q14651 629 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 SPATC1LQ9H0A9 340 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 DNM1LO00429 736 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 PRKAB2O43741 272 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 MSCO60682 206 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 COBLO75128 1261 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 IGHA2P01877 340 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 ERCC3P19447 782 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 MYH8P13535 1937 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 SMIM22K7EJ46 135 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 RTP1P59025 263 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRN-217ENST00000489650 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 STRNO43815 780 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 AKR1B1P15121 316 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 DSG3P32926 999 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 UNC80Q8N2C7 3258 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 ATG4CQ96DT6 458 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 FAM161BQ96MY7 647 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 FLOT1O75955 427 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 MBD4O95243 580 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 CHGBP05060 677 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 SWAP70Q9UH65 585 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 MROH8Q9H579 483 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 TMX2Q9Y320 296 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 KBTBD13C9JR72 458 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 POTEB2H3BUK9 544 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 SEPT4O43236 478 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 ADD2P35612 726 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 ICA1Q05084 483 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 MIER1Q8N108 512 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 FERMT2Q96AC1 680 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 VCPKMTQ9H867 229 aa22.28■■□□□ 1.16
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PTPRN-217ENST00000489650 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 LTBP2Q14767 1821 aa22.28■■□□□ 1.16
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PTPRN-217ENST00000489650 CDK8P49336 464 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 MB21D1Q8N884 522 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 MAML3Q96JK9 1138 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 GUCD1Q96NT3 240 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 SLC5A4Q9NY91 659 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRN-217ENST00000489650 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 USP17L12C9JPN9 530 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 USP17L21D6R901 530 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 SHHQ15465 462 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 TRIM60Q495X7 471 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRN-217ENST00000489650 C12orf60Q5U649 245 aa22.26■■□□□ 1.15
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PTPRN-217ENST00000489650 FCER1AP12319 257 aa22.25■■□□□ 1.15
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