RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487849.7

HOXB-AS3-212, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 428 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SPICE1Q8N0Z3 855 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ARMC5Q96C12 935 aa23.5■■□□□ 1.35
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 SIAH1Q8IUQ4 282 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HOXC10Q9NYD6 342 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa23.48■■□□□ 1.35
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 NYAP2Q9P242 653 aa23.47■■□□□ 1.35
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 ANAPC4Q9UJX5 808 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GABRQQ9UN88 632 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TSPY2A6NKD2 308 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TTLL1O95922 423 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FAM47AQ5JRC9 791 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LBX2Q6XYB7 198 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NEDD1Q8NHV4 660 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CEP95Q96GE4 821 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ADCY3O60266 1144 aa23.44■■□□□ 1.34
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 MYCP01106 439 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 UBXN2AP68543 259 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 WDR78Q5VTH9 848 aa23.44■■□□□ 1.34
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 MB21D1Q8N884 522 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RUFY2Q8WXA3 655 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SOCS4Q8WXH5 440 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HAND2P61296 217 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 Q3C1V9 767 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 F5H6K3 240 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ORC4O43929 436 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DSG3P32926 999 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KLRC3Q07444 240 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FAM83BQ5T0W9 1011 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PLEKHH3Q7Z736 793 aa23.41■■□□□ 1.34
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PORCNQ9H237 461 aa23.41■■□□□ 1.34
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF213O14771 459 aa23.4■■□□□ 1.34
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 PCP11498 1178 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
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HOXB-AS3-212ENST00000487849 MFSD6Q6ZSS7 791 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GPR142Q7Z601 462 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MKL1Q969V6 931 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 INCENPQ9NQS7 918 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BTBD7Q9P203 1132 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CTNNA3Q9UI47 895 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RAD50Q92878 1312 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NDUFB10O96000 172 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ELNP15502 786 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 POTEEQ6S8J3 1075 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DSCC1Q9BVC3 393 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
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