RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486480.1

PTPRN-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-216ENST00000486480 ERO1AQ96HE7 468 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRN-216ENST00000486480 USP17L15C9J2P7 530 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 USP17L11C9JVI0 530 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 USP17L18D6R9N7 530 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 USP17L22D6RA61 530 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 USP17L19D6RCP7 530 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 USP17L20D6RJB6 530 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 TTLL1O95922 423 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 USP17L24Q0WX57 530 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 MAP4K1Q92918 833 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 GOPCQ9HD26 462 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 NMT2O60551 498 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 HERVK_113P62684 666 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 CYP21A2P08686 494 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 NT5C2P49902 561 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 CAP1Q01518 475 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 ESR2Q92731 530 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 MKL1Q969V6 931 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 RAD21O60216 631 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 NDUFB10O96000 172 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 STX8Q9UNK0 236 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 B4E1Z4 1266 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 F5H6K3 240 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 KDM4AO75164 1064 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 NOVP48745 357 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 KLRC3Q07444 240 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 KIF22Q14807 665 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 TNS4Q8IZW8 715 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 KRT23Q9C075 422 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 TRIM17Q9Y577 477 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRN-216ENST00000486480 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 LBX2Q6XYB7 198 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 EFCC1Q9HA90 598 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 FLOT1O75955 427 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 CTGFP29279 349 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 COG2Q14746 738 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 ARHGEF6Q15052 776 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 TRIM47Q96LD4 638 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 MYPNQ86TC9 1320 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 PEX10O60683 326 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 PSMC4P43686 418 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 TRDNQ13061 729 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 SLFN13Q68D06 897 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 IQCA1Q86XH1 822 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 E7EWF7 191 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 FCGRTP55899 365 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 ERVK-9P63128 1117 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 ERVK-24P63145 666 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRN-216ENST00000486480 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.54■■□□□ 1.2
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