RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 GOPCQ9HD26 462 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP4-209ENST00000484097 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP4-209ENST00000484097 MYPNQ86TC9 1320 aa22.89■■□□□ 1.26
SH3BP4-209ENST00000484097 TFAP4Q01664 338 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 NYAP2Q9P242 653 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 COG2Q14746 738 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 TOMM22Q9NS69 142 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 TSPY2A6NKD2 308 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 MYH4Q9Y623 1939 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 ZMYM6O95789 1325 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 ERVK-9P63128 1117 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 ERVK-24P63145 666 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 PRKCZQ05513 592 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 INCENPQ9NQS7 918 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 TTLL1O95922 423 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 HAND2P61296 217 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 CCNA1P78396 465 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 Q3C1V9 767 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 CEP95Q96GE4 821 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 GABRQQ9UN88 632 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF213O14771 459 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 PEX10O60683 326 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 FLOT1O75955 427 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 FLT3LGP49771 235 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 SOX10P56693 466 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 LBX2Q6XYB7 198 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 ARMC5Q96C12 935 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 ORC4O43929 436 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 CHMLP26374 656 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 MAPK4P31152 587 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 MKL1Q969V6 931 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP4-209ENST00000484097 RAD50Q92878 1312 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP4-209ENST00000484097 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP4-209ENST00000484097 F5H6K3 240 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP4-209ENST00000484097 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SH3BP4-209ENST00000484097 GRK4P32298 578 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP4-209ENST00000484097 DSG3P32926 999 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP4-209ENST00000484097 KLRC3Q07444 240 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP4-209ENST00000484097 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP4-209ENST00000484097 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.82■■□□□ 1.24
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SH3BP4-209ENST00000484097 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP4-209ENST00000484097 WDR78Q5VTH9 848 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP4-209ENST00000484097 MB21D1Q8N884 522 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP4-209ENST00000484097 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.81■■□□□ 1.24
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SH3BP4-209ENST00000484097 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.8■■□□□ 1.24
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SH3BP4-209ENST00000484097 BTBD7Q9P203 1132 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP4-209ENST00000484097 STX8Q9UNK0 236 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP4-209ENST00000484097 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP4-209ENST00000484097 NDUFB10O96000 172 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP4-209ENST00000484097 UBXN2AP68543 259 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP4-209ENST00000484097 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP4-209ENST00000484097 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SH3BP4-209ENST00000484097 ATG4CQ96DT6 458 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP4-209ENST00000484097 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP4-209ENST00000484097 PORCNQ9H237 461 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP4-209ENST00000484097 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SH3BP4-209ENST00000484097 PLS1Q14651 629 aa22.78■■□□□ 1.24
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