RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480371.1

TTC23-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 23, human

TSL 5

Gene TTC23, Length 776 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC23-208	ENST00000480371	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TTC23-208	ENST00000480371	MB21D1	Q8N884	522 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTC23-208	ENST00000480371	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTC23-208	ENST00000480371	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TTC23-208	ENST00000480371	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTC23-208	ENST00000480371	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTC23-208	ENST00000480371	VCPKMT	Q9H867	229 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTC23-208	ENST00000480371	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTC23-208	ENST00000480371		A0A1W2PRG0	241 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	TSPY3	P0CV98	308 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	TSPY8	P0CW00	308 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	RASA1	P20936	1047 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	PDE4A	P27815	886 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	ALX1	Q15699	326 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	TTC22	Q5TAA0	569 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	NYAP2	Q9P242	653 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	GABRQ	Q9UN88	632 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	FLOT1	O75955	427 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	PPARA	Q07869	468 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	RAD21	O60216	631 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	SDS	P20132	328 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	SMIM22	K7EJ46	135 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	STRN	O43815	780 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	TTLL1	O95922	423 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	DSG3	P32926	999 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	RGS2	P41220	211 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371		Q3C1V9	767 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	WDR78	Q5VTH9	848 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	GPR142	Q7Z601	462 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	MKL1	Q969V6	931 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	FAM227B	Q96M60	508 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	RNF208	Q9H0X6	261 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	GJD2	Q9UKL4	321 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	ZMYM6	O95789	1325 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371		A0A0D9SFI3	127 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	POTEF	A5A3E0	1075 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	TSPY2	A6NKD2	308 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	PRDM1	O75626	825 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	HMGCR	P04035	888 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	GJB1	P08034	283 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	CCL5	P13501	91 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	COPB2	P35606	906 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	NT5C2	P49902	561 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	TFAP4	Q01664	338 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	CASC1	Q6TDU7	716 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371		F5H6K3	240 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	SLC25A27	O95847	323 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	FGA	P02671	866 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	INHA	P05111	366 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	ELN	P15502	786 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	KLRC3	Q07444	240 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	PLS1	Q14651	629 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	CEP95	Q96GE4	821 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	12.78	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	PORCN	Q9H237	461 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	MROH8	Q9H579	483 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	TOMM22	Q9NS69	142 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC23-208	ENST00000480371	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		12.78	□□□□□ -0.36

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