RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480020.5

HPS1-212, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 795 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-212ENST00000480020 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 USP17L24Q0WX57 530 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 POTEEQ6S8J3 1075 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 MFSD6Q6ZSS7 791 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 TNS4Q8IZW8 715 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 MKL1Q969V6 931 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 IL17RBQ9NRM6 502 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 NMT2O60551 498 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 CDC45O75419 566 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 TTLL1O95922 423 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 CTGFP29279 349 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 NOVP48745 357 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 HERVK_113P62684 666 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 FAM110CQ1W6H9 321 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 MAP4K1Q92918 833 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 MCOLN1Q9GZU1 580 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 GOPCQ9HD26 462 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 TOMM22Q9NS69 142 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 CLIP2Q9UDT6 1046 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 LAMA4Q16363 1823 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 WDR46O15213 610 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 TXNRD2Q9NNW7 524 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 MORF4L1Q9UBU8 362 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 F5H6K3 240 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 PEX10O60683 326 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 NDUFB10O96000 172 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 CYP21A2P08686 494 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 KLRC3Q07444 240 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 KIF22Q14807 665 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 LBX2Q6XYB7 198 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 ESR2Q92731 530 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 EFCC1Q9HA90 598 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 RBPJLQ9UBG7 517 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 TRIM17Q9Y577 477 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HPS1-212ENST00000480020 CNMDO75829 334 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 PSMC4P43686 418 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 NT5C2P49902 561 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 CASC1Q6TDU7 716 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 TRIM47Q96LD4 638 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 STX8Q9UNK0 236 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 TAF6LQ9Y6J9 622 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 B4E1Z4 1266 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 RAD21O60216 631 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 KDM4AO75164 1064 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 FLOT1O75955 427 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 COG2Q14746 738 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 ARHGEF6Q15052 776 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 ANO2Q9NQ90 1003 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 MYPNQ86TC9 1320 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 GNRH1P01148 92 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 DSG3P32926 999 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 FCGRTP55899 365 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 ERVK-9P63128 1117 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 ERVK-24P63145 666 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 Q3C1V9 767 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 SLFN13Q68D06 897 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 RCSD1Q6JBY9 416 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 ATG4CQ96DT6 458 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 PAGR1Q9BTK6 254 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 KRT23Q9C075 422 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 CNNM2Q9H8M5 875 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 FBXO28Q9NVF7 368 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 BTBD7Q9P203 1132 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 RLFQ13129 1914 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 ABHD8Q96I13 439 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-212ENST00000480020 GMCL1Q96IK5 515 aa14.67□□□□□ -0.06
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