RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 SPICE1Q8N0Z3 855 aa23.64■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa23.64■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.64■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 RBPJLQ9UBG7 517 aa23.64■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa23.63■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 TSPY3P0CV98 308 aa23.63■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 TSPY8P0CW00 308 aa23.63■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa23.63■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 NEDD1Q8NHV4 660 aa23.63■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 PAGR1Q9BTK6 254 aa23.63■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 TANGO6Q9C0B7 1094 aa23.63■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 GOPCQ9HD26 462 aa23.63■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 NYAP2Q9P242 653 aa23.63■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 PEX10O60683 326 aa23.62■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 NEFLP07196 543 aa23.62■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 TFAP4Q01664 338 aa23.62■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 PRKCZQ05513 592 aa23.62■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 FAM47AQ5JRC9 791 aa23.62■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 RAET1EQ8TD07 263 aa23.62■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 COA7Q96BR5 231 aa23.62■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 ARMC5Q96C12 935 aa23.62■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 CEP95Q96GE4 821 aa23.62■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 PLIN4Q96Q06 1357 aa23.62■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 DOCK3Q8IZD9 2030 aa23.61■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 WDR46O15213 610 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 ERVK-9P63128 1117 aa23.61■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 ERVK-24P63145 666 aa23.61■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 COG2Q14746 738 aa23.61■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 POTEEQ6S8J3 1075 aa23.61■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 LBX2Q6XYB7 198 aa23.61■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 NBPF11Q86T75 865 aa23.61■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 INCENPQ9NQS7 918 aa23.61■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 MTMR4Q9NYA4 1195 aa23.61■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 HOXC10Q9NYD6 342 aa23.61■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23.61■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 GABRQQ9UN88 632 aa23.61■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.61■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 ORC4O43929 436 aa23.6■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 RAD21O60216 631 aa23.6■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.6■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 TSPY2A6NKD2 308 aa23.59■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 TTLL1O95922 423 aa23.59■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 FGRP09769 529 aa23.59■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 FLT3LGP49771 235 aa23.59■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 SOX10P56693 466 aa23.59■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 HAND2P61296 217 aa23.59■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 Q3C1V9 767 aa23.59■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 DSCC1Q9BVC3 393 aa23.59■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 TACC3Q9Y6A5 838 aa23.59■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 MYH4Q9Y623 1939 aa23.59■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 CNMDO75829 334 aa23.58■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 FLOT1O75955 427 aa23.58■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 CHMLP26374 656 aa23.58■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 SH3TC2Q8TF17 1288 aa23.58■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 RUFY2Q8WXA3 655 aa23.58■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 MKL1Q969V6 931 aa23.58■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 TOMM22Q9NS69 142 aa23.58■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa23.58■■□□□ 1.37
CTPS1-206ENST00000470271 RAD50Q92878 1312 aa23.58■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 BRCA2P51587 3418 aa23.58■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 F5H6K3 240 aa23.57■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF213O14771 459 aa23.57■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 PCP11498 1178 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 MAPK4P31152 587 aa23.57■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 CCNA1P78396 465 aa23.57■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 KLRC3Q07444 240 aa23.57■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.57■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF333Q96JL9 665 aa23.57■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 IL25Q9H293 177 aa23.57■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 RLFQ13129 1914 aa23.57■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 NDUFB10O96000 172 aa23.56■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 GRK4P32298 578 aa23.56■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 DSG3P32926 999 aa23.56■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 IRF5Q13568 498 aa23.56■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 FAM83BQ5T0W9 1011 aa23.56■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 AKNAD1Q5T1N1 836 aa23.56■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 NBPF3Q9H094 633 aa23.56■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 PORCNQ9H237 461 aa23.56■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 BTBD7Q9P203 1132 aa23.56■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 MFSD6Q6ZSS7 791 aa23.55■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 MB21D1Q8N884 522 aa23.55■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 SLAIN1Q8ND83 568 aa23.55■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 STAG1Q8WVM7 1258 aa23.55■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 CTNNA3Q9UI47 895 aa23.55■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 RGS19P49795 217 aa23.54■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 SKAP1Q86WV1 359 aa23.54■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 TBC1D10CQ8IV04 446 aa23.54■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa23.54■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 ATG4CQ96DT6 458 aa23.54■■□□□ 1.36
CTPS1-206ENST00000470271 IL17RBQ9NRM6 502 aa23.54■■□□□ 1.36
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