RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469025.1

OPTN-209, Transcript of optineurin, humanhuman

TSL 3

Gene OPTN, Length 642 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-209ENST00000469025 ALADP13716 330 aa7.57□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 CD33P20138 364 aa7.57□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 PDE3AQ14432 1141 aa7.57□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 SHHQ15465 462 aa7.57□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 GPAT2Q6NUI2 795 aa7.57□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 NME9Q86XW9 330 aa7.57□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 PRRX2Q99811 253 aa7.57□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 SRRDQ9UH36 339 aa7.57□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 MKL2Q9ULH7 1088 aa7.57□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.57□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 SPG7Q9UQ90 795 aa7.57□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 A6NJR5 290 aa7.56□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.56□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 EFSO43281 561 aa7.56□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 EPXP11678 715 aa7.56□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 ADH6P28332 368 aa7.56□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 LAMC2Q13753 1193 aa7.56□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa7.56□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 LDLRAD1Q5T700 205 aa7.56□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 RAET1EQ8TD07 263 aa7.56□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 DEFB118Q96PH6 123 aa7.56□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 ZNF576Q9H609 170 aa7.56□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 CD320Q9NPF0 282 aa7.56□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 A0A1W2PP64 1363 aa7.56□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 RTL1A6NKG5 1358 aa7.56□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 SPTBN2O15020 2390 aa7.55□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 NCAPD2Q15021 1401 aa7.55□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 NEURL1BA8MQ27 555 aa7.55□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 ERC2O15083 957 aa7.55□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 PHKG2P15735 406 aa7.55□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 AMPD1P23109 780 aa7.55□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 TCF15Q12870 199 aa7.55□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.55□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.55□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 ANKS1AQ92625 1134 aa7.55□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 MFSD14AQ96MC6 490 aa7.55□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 PTPN18Q99952 460 aa7.55□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 MARK1Q9P0L2 795 aa7.55□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 DMXL1Q9Y485 3027 aa7.55□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 ADGRA2Q96PE1 1338 aa7.54□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 DNAH12Q6ZR08 3092 aa7.54□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 PROB1E7EW31 1015 aa7.54□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 DKK1O94907 266 aa7.54□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 AMPHP49418 695 aa7.54□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 PRKG1Q13976 671 aa7.54□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa7.54□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 C9orf50Q5SZB4 431 aa7.54□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 ARMC9Q7Z3E5 817 aa7.54□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 WNK4Q96J92 1243 aa7.54□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 SETDB2Q96T68 719 aa7.54□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 C11orf49Q9H6J7 331 aa7.54□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa7.54□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 CHMP3Q9Y3E7 222 aa7.54□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 ASPMQ8IZT6 3477 aa7.53□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 PTPN13Q12923 2485 aa7.53□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 SFI1A8K8P3 1242 aa7.53□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 RASA1P20936 1047 aa7.53□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 RPS12P25398 132 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 HOXD10P28358 340 aa7.53□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 C1orf53Q5VUE5 145 aa7.53□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa7.53□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.53□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 BTBD6Q96KE9 485 aa7.53□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 KLF15Q9UIH9 416 aa7.53□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa7.53□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 COL4A6Q14031 1691 aa7.53□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 BPTFQ12830 3046 aa7.53□□□□□ -1.2
OPTN-209ENST00000469025 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa7.52□□□□□ -1.21
OPTN-209ENST00000469025 A0A087WZG4 1122 aa7.52□□□□□ -1.21
OPTN-209ENST00000469025 PIK3R2O00459 728 aa7.52□□□□□ -1.21
OPTN-209ENST00000469025 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
OPTN-209ENST00000469025 NF2P35240 595 aa7.52□□□□□ -1.21
OPTN-209ENST00000469025 ADGRE1Q14246 886 aa7.52□□□□□ -1.21
OPTN-209ENST00000469025 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
OPTN-209ENST00000469025 LINC00114Q6XXX2 140 aa7.52□□□□□ -1.21
OPTN-209ENST00000469025 HFE2Q6ZVN8 426 aa7.52□□□□□ -1.21
OPTN-209ENST00000469025 ASCL5Q7RTU5 278 aa7.52□□□□□ -1.21
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