RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464280.5

NISCH-204, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 3

Gene NISCH, Length 833 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-204ENST00000464280 PRDM1O75626 825 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 TSPY3P0CV98 308 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 TSPY8P0CW00 308 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 CTDSPL2Q05D32 466 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 NBPF11Q86T75 865 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 CLEC10AQ8IUN9 316 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 SIAH1Q8IUQ4 282 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 CCDC136Q96JN2 1154 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 NYAP2Q9P242 653 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 MORF4L1Q9UBU8 362 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 SRRDQ9UH36 339 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 MYPNQ86TC9 1320 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 PLXNB2O15031 1838 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 PLIN4Q96Q06 1357 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 WDR46O15213 610 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 CTGFP29279 349 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 COG2Q14746 738 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 LBX2Q6XYB7 198 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 NEDD1Q8NHV4 660 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 RUFY2Q8WXA3 655 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 COA7Q96BR5 231 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP13.84□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 TANGO6Q9C0B7 1094 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 HOXC10Q9NYD6 342 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 RAD50Q92878 1312 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-204ENST00000464280 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 TSPY2A6NKD2 308 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 TTLL1O95922 423 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 PCP11498 1178 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 TFAP4Q01664 338 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 SPICE1Q8N0Z3 855 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 RAET1EQ8TD07 263 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 CEP95Q96GE4 821 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 PAGR1Q9BTK6 254 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 DSCC1Q9BVC3 393 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 MTMR4Q9NYA4 1195 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 RBPJLQ9UBG7 517 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP13.83□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 ORC4O43929 436 aa13.82□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 RAD21O60216 631 aa13.82□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 FGRP09769 529 aa13.82□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 ERVK-9P63128 1117 aa13.82□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 ERVK-24P63145 666 aa13.82□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 CCNA1P78396 465 aa13.82□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 FAM47AQ5JRC9 791 aa13.82□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 MFSD6Q6ZSS7 791 aa13.82□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 MKL1Q969V6 931 aa13.82□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 ARMC5Q96C12 935 aa13.82□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 TXNRD2Q9NNW7 524 aa13.82□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 TOMM22Q9NS69 142 aa13.82□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 CLIP2Q9UDT6 1046 aa13.82□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 CTNNA3Q9UI47 895 aa13.82□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 ZNF213O14771 459 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 FLOT1O75955 427 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 CHMLP26374 656 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 MAPK4P31152 587 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 PRKCZQ05513 592 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 AKNAD1Q5T1N1 836 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 MB21D1Q8N884 522 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 F5H6K3 240 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 NT5C2P49902 561 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 HAND2P61296 217 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 KLRC3Q07444 240 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 IRF5Q13568 498 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 Q3C1V9 767 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 SLAIN1Q8ND83 568 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 STAG1Q8WVM7 1258 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 INCENPQ9NQS7 918 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 GABRQQ9UN88 632 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 BRCA2P51587 3418 aa13.79□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 GRK4P32298 578 aa13.79□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 DSG3P32926 999 aa13.79□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 FLT3LGP49771 235 aa13.79□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 ERICH6BQ5W0A0 696 aa13.79□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa13.79□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 ZNF333Q96JL9 665 aa13.79□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 STX8Q9UNK0 236 aa13.79□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 ADCY3O60266 1144 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 PEX10O60683 326 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 CNMDO75829 334 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-204ENST00000464280 NDUFB10O96000 172 aa13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms