RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462123.5

SIKE1-204, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIKE1, Length 394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-204ENST00000462123 GPR142Q7Z601 462 aa24.92■■□□□ 1.58
SIKE1-204ENST00000462123 IFNL3Q8IZI9 196 aa24.92■■□□□ 1.58
SIKE1-204ENST00000462123 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
SIKE1-204ENST00000462123 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
SIKE1-204ENST00000462123 SMIM22K7EJ46 135 aa24.91■■□□□ 1.58
SIKE1-204ENST00000462123 WDR46O15213 610 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SIKE1-204ENST00000462123 SGPL1O95470 568 aa24.91■■□□□ 1.58
SIKE1-204ENST00000462123 APPP05067 770 aa24.91■■□□□ 1.58
SIKE1-204ENST00000462123 MORN1Q5T089 497 aa24.91■■□□□ 1.58
SIKE1-204ENST00000462123 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SIKE1-204ENST00000462123 UNC93B1Q9H1C4 597 aa24.91■■□□□ 1.58
SIKE1-204ENST00000462123 PORCNQ9H237 461 aa24.91■■□□□ 1.58
SIKE1-204ENST00000462123 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa24.91■■□□□ 1.58
SIKE1-204ENST00000462123 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
SIKE1-204ENST00000462123 MINDY4BA8MYZ0 360 aa24.9■■□□□ 1.58
SIKE1-204ENST00000462123 EEF2P13639 858 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
SIKE1-204ENST00000462123 RASA1P20936 1047 aa24.9■■□□□ 1.58
SIKE1-204ENST00000462123 SHISA4Q96DD7 197 aa24.9■■□□□ 1.58
SIKE1-204ENST00000462123 NYAP2Q9P242 653 aa24.9■■□□□ 1.58
SIKE1-204ENST00000462123 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
SIKE1-204ENST00000462123 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
SIKE1-204ENST00000462123 DSG3P32926 999 aa24.89■■□□□ 1.58
SIKE1-204ENST00000462123 RGS2P41220 211 aa24.89■■□□□ 1.58
SIKE1-204ENST00000462123 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa24.89■■□□□ 1.58
SIKE1-204ENST00000462123 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.58
SIKE1-204ENST00000462123 GOPCQ9HD26 462 aa24.89■■□□□ 1.58
SIKE1-204ENST00000462123 HELLSQ9NRZ9 838 aa24.89■■□□□ 1.58
SIKE1-204ENST00000462123 RPTORQ8N122 1335 aa24.88■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 SLC15A5A6NIM6 579 aa24.88■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 SHCBP1Q8NEM2 672 aa24.88■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 TANGO6Q9C0B7 1094 aa24.88■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa24.88■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24.88■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 BTBD7Q9P203 1132 aa24.88■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 STRNO43815 780 aa24.87■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 PEX10O60683 326 aa24.87■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 PDE4BQ07343 736 aa24.87■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa24.87■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa24.87■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.87■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.87■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 NAPBQ9H115 298 aa24.87■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 HOXC6P09630 235 aa24.86■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 CYP2B6P20813 491 aa24.86■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 PTPREP23469 700 aa24.86■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 NUCB1Q02818 461 aa24.86■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 MAP2K5Q13163 448 aa24.86■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 MKL1Q969V6 931 aa24.86■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 APBA2Q99767 749 aa24.86■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 LNPKQ9C0E8 428 aa24.86■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa24.86■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa24.86■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa24.85■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 FLOT1O75955 427 aa24.85■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 ALX1Q15699 326 aa24.85■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.85■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 CLEC10AQ8IUN9 316 aa24.85■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 TRIB2Q92519 343 aa24.85■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 SPATC1LQ9H0A9 340 aa24.85■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP24.85■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 MGAMO43451 1857 aa24.85■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 BRCA2P51587 3418 aa24.84■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 IGHDP01880 384 aa24.84■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 GRB14Q14449 540 aa24.84■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 ANKLE1Q8NAG6 615 aa24.84■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 DEFB118Q96PH6 123 aa24.84■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 MROH8Q9H579 483 aa24.84■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 MYH7P12883 1935 aa24.84■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa24.83■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 ATP2B2Q01814 1243 aa24.83■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 PPARAQ07869 468 aa24.83■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 ABRAQ8N0Z2 381 aa24.83■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 SPICE1Q8N0Z3 855 aa24.83■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 NEDD1Q8NHV4 660 aa24.83■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 HTATIP2Q9BUP3 242 aa24.83■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 ANAPC4Q9UJX5 808 aa24.83■■□□□ 1.57
SIKE1-204ENST00000462123 PLIN4Q96Q06 1357 aa24.82■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 SLC25A27O95847 323 aa24.82■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 TFRCP02786 760 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa24.82■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 MTMR4Q9NYA4 1195 aa24.82■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa24.81■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 F5H6K3 240 aa24.8■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 FOXP2O15409 715 aa24.8■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 TTLL1O95922 423 aa24.8■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 COPB2P35606 906 aa24.8■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 KLRC3Q07444 240 aa24.8■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.8■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 ATG4CQ96DT6 458 aa24.8■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa24.8■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 TSPY3P0CV98 308 aa24.79■■□□□ 1.56
SIKE1-204ENST00000462123 TSPY8P0CW00 308 aa24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms