RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 NFIAQ12857 509 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-205ENST00000462042 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-205ENST00000462042 RASA3Q14644 834 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-205ENST00000462042 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-205ENST00000462042 SFRP5Q5T4F7 317 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-205ENST00000462042 C22orf34Q6ZV56 151 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-205ENST00000462042 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-205ENST00000462042 RIN3Q8TB24 985 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-205ENST00000462042 SNTG2Q9NY99 539 aa8.38□□□□□ -1.07
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RABGGTB-205ENST00000462042 LEFTY1O75610 366 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa8.37□□□□□ -1.07
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RABGGTB-205ENST00000462042 VWCEQ96DN2 955 aa8.37□□□□□ -1.07
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RABGGTB-205ENST00000462042 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
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RABGGTB-205ENST00000462042 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-205ENST00000462042 IGLV1-40P01703 118 aa8.36□□□□□ -1.07
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RABGGTB-205ENST00000462042 DOC2BQ14184 412 aa8.36□□□□□ -1.07
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RABGGTB-205ENST00000462042 PPFIBP1Q86W92 1011 aa8.35□□□□□ -1.07
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RABGGTB-205ENST00000462042 MKNK2Q9HBH9 465 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-205ENST00000462042 PRR13Q9NZ81 148 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-205ENST00000462042 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
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RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC85CA6NKD9 419 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-205ENST00000462042 GNAT3A8MTJ3 354 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-205ENST00000462042 B2RBV5 119 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-205ENST00000462042 C9IYK1 514 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-205ENST00000462042 TP53P04637 393 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
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RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-205ENST00000462042 FSTP19883 344 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-205ENST00000462042 AUHQ13825 339 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-205ENST00000462042 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
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RABGGTB-205ENST00000462042 APBA2Q99767 749 aa8.34□□□□□ -1.07
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RABGGTB-205ENST00000462042 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
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RABGGTB-205ENST00000462042 SHKBP1Q8TBC3 707 aa8.32□□□□□ -1.08
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RABGGTB-205ENST00000462042 KLHL25Q9H0H3 589 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 WHRNQ9P202 907 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 FBXL21Q9UKT6 434 aa8.32□□□□□ -1.08
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RABGGTB-205ENST00000462042 CBX7O95931 251 aa8.31□□□□□ -1.08
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RABGGTB-205ENST00000462042 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 SGSM3Q96HU1 749 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 DYRK3O43781 588 aa8.3□□□□□ -1.08
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RABGGTB-205ENST00000462042 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 DTWD2Q8NBA8 298 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 GP6Q9HCN6 339 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 SUSD2Q9UGT4 822 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 LEMD3Q9Y2U8 911 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 CBFA2T2O43439 604 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-205ENST00000462042 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.29□□□□□ -1.08
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