RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452174.5

CERKL-208, Transcript of ceramide kinase like, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CERKL, Length 1,403 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKL-208ENST00000452174 LPAR1Q92633 364 aa23.09■■□□□ 1.29
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CERKL-208ENST00000452174 ZNF333Q96JL9 665 aa23.09■■□□□ 1.29
CERKL-208ENST00000452174 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
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CERKL-208ENST00000452174 TTC22Q5TAA0 569 aa23.08■■□□□ 1.29
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CERKL-208ENST00000452174 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa23.08■■□□□ 1.29
CERKL-208ENST00000452174 DOCK3Q8IZD9 2030 aa23.08■■□□□ 1.29
CERKL-208ENST00000452174 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa23.08■■□□□ 1.28
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CERKL-208ENST00000452174 LBX2Q6XYB7 198 aa23.07■■□□□ 1.28
CERKL-208ENST00000452174 ANAPC4Q9UJX5 808 aa23.07■■□□□ 1.28
CERKL-208ENST00000452174 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
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CERKL-208ENST00000452174 TSPY8P0CW00 308 aa23.06■■□□□ 1.28
CERKL-208ENST00000452174 GRK4P32298 578 aa23.06■■□□□ 1.28
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CERKL-208ENST00000452174 GOPCQ9HD26 462 aa23.06■■□□□ 1.28
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CERKL-208ENST00000452174 IRF5Q13568 498 aa23.05■■□□□ 1.28
CERKL-208ENST00000452174 FAM47AQ5JRC9 791 aa23.05■■□□□ 1.28
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CERKL-208ENST00000452174 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23.05■■□□□ 1.28
CERKL-208ENST00000452174 ZMYM6O95789 1325 aa23.05■■□□□ 1.28
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CERKL-208ENST00000452174 CEP95Q96GE4 821 aa23.04■■□□□ 1.28
CERKL-208ENST00000452174 PORCNQ9H237 461 aa23.04■■□□□ 1.28
CERKL-208ENST00000452174 MTMR4Q9NYA4 1195 aa23.04■■□□□ 1.28
CERKL-208ENST00000452174 BTBD7Q9P203 1132 aa23.04■■□□□ 1.28
CERKL-208ENST00000452174 TACC3Q9Y6A5 838 aa23.04■■□□□ 1.28
CERKL-208ENST00000452174 RLFQ13129 1914 aa23.04■■□□□ 1.28
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CERKL-208ENST00000452174 TMEM106CQ9BVX2 250 aa23.02■■□□□ 1.28
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CERKL-208ENST00000452174 TTLL1O95922 423 aa23.01■■□□□ 1.27
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CERKL-208ENST00000452174 F5H6K3 240 aa23■■□□□ 1.27
CERKL-208ENST00000452174 ELNP15502 786 aa23■■□□□ 1.27
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CERKL-208ENST00000452174 KLRC3Q07444 240 aa23■■□□□ 1.27
CERKL-208ENST00000452174 FAM83BQ5T0W9 1011 aa23■■□□□ 1.27
CERKL-208ENST00000452174 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
CERKL-208ENST00000452174 GPR142Q7Z601 462 aa23■■□□□ 1.27
CERKL-208ENST00000452174 ATG4CQ96DT6 458 aa23■■□□□ 1.27
CERKL-208ENST00000452174 PLXNB2O15031 1838 aa23■■□□□ 1.27
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CERKL-208ENST00000452174 PARP14Q460N5 1801 aa23■■□□□ 1.27
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CERKL-208ENST00000452174 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.99■■□□□ 1.27
CERKL-208ENST00000452174 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.99■■□□□ 1.27
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CERKL-208ENST00000452174 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
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CERKL-208ENST00000452174 IL25Q9H293 177 aa22.99■■□□□ 1.27
CERKL-208ENST00000452174 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CERKL-208ENST00000452174 TOMM22Q9NS69 142 aa22.99■■□□□ 1.27
CERKL-208ENST00000452174 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.99■■□□□ 1.27
CERKL-208ENST00000452174 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.98■■□□□ 1.27
CERKL-208ENST00000452174 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
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