RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 GRB14Q14449 540 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-210ENST00000442481 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
PRAME-210ENST00000442481 ADGRA1Q86SQ6 560 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-210ENST00000442481 DPP9Q86TI2 863 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-210ENST00000442481 FAM161BQ96MY7 647 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-210ENST00000442481 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-210ENST00000442481 DNAH12Q6ZR08 3092 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-210ENST00000442481 ZAP70P43403 619 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-210ENST00000442481 MB21D1Q8N884 522 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-210ENST00000442481 EXOC6Q8TAG9 804 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-210ENST00000442481 LRRCC1Q9C099 1032 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-210ENST00000442481 FLRT1Q9NZU1 646 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-210ENST00000442481 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-210ENST00000442481 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 CNMDO75829 334 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 OLFML2BQ68BL8 750 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 MAGEB6Q8N7X4 407 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 SHCBP1Q8NEM2 672 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 SH2D4AQ9H788 454 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 RTP1P59025 263 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 COG2Q14746 738 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 MIGA1Q8NAN2 632 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 MROH8Q9H579 483 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 LTBP2Q14767 1821 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 SEPT4O43236 478 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 CYBAP13498 195 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 CYP2C19P33261 490 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 ABRAQ8N0Z2 381 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 ADORA2AP29274 412 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 SPATC1LQ9H0A9 340 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 BTBD7Q9P203 1132 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 SWAP70Q9UH65 585 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 VCANP13611 3396 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 SHMT1P34896 483 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 C1orf53Q5VUE5 145 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 AMOTL1Q8IY63 956 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 TRPV1Q8NER1 839 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 NPLOC4Q8TAT6 608 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 ACER1Q8TDN7 264 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 ANTXR1Q9H6X2 564 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 TMEM265A0A087WTH1 108 aa14.03□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 GOLIM4O00461 696 aa14.03□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 SLC25A27O95847 323 aa14.03□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 IGHA2P01877 340 aa14.03□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 SNX17Q15036 470 aa14.03□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 SHHQ15465 462 aa14.03□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 BOLA2Q9H3K6 86 aa14.03□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 DCTPP1Q9H773 170 aa14.03□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 MCM9Q9NXL9 1143 aa14.03□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 NAV1Q8NEY1 1877 aa14.03□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 RLFQ13129 1914 aa14.02□□□□□ -0.16
PRAME-210ENST00000442481 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.17
PRAME-210ENST00000442481 FCER1AP12319 257 aa14.02□□□□□ -0.17
PRAME-210ENST00000442481 ERCC3P19447 782 aa14.02□□□□□ -0.17
PRAME-210ENST00000442481 COPB2P35606 906 aa14.02□□□□□ -0.17
PRAME-210ENST00000442481 PLS1Q14651 629 aa14.02□□□□□ -0.17
PRAME-210ENST00000442481 SEPT2Q15019 361 aa14.02□□□□□ -0.17
PRAME-210ENST00000442481 C9orf50Q5SZB4 431 aa14.02□□□□□ -0.17
PRAME-210ENST00000442481 ERICH6BQ5W0A0 696 aa14.02□□□□□ -0.17
PRAME-210ENST00000442481 RNF180Q86T96 592 aa14.02□□□□□ -0.17
PRAME-210ENST00000442481 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.17
PRAME-210ENST00000442481 DDRGK1Q96HY6 314 aa14.02□□□□□ -0.17
PRAME-210ENST00000442481 GPATCH3Q96I76 525 aa14.02□□□□□ -0.17
PRAME-210ENST00000442481 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.02□□□□□ -0.17
PRAME-210ENST00000442481 FLOT1O75955 427 aa14.01□□□□□ -0.17
PRAME-210ENST00000442481 RARBP10826 455 aa14.01□□□□□ -0.17
PRAME-210ENST00000442481 PLCD1P51178 756 aa14.01□□□□□ -0.17
PRAME-210ENST00000442481 GABPAQ06546 454 aa14.01□□□□□ -0.17
PRAME-210ENST00000442481 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa14.01□□□□□ -0.17
PRAME-210ENST00000442481 TSHZ3Q63HK5 1081 aa14.01□□□□□ -0.17
PRAME-210ENST00000442481 NCAPG2Q86XI2 1143 aa14.01□□□□□ -0.17
PRAME-210ENST00000442481 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
PRAME-210ENST00000442481 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
PRAME-210ENST00000442481 SEMA6BQ9H3T3 888 aa14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms